Η βασική διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικού όπλου είναι ότι στην ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικού όπλου, το γονιδίωμα χωρίζεται σε μεγαλύτερα θραύσματα πριν από τον προσδιορισμό της αλληλουχίας, ενώ, στην αλληλουχία του κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος, ολόκληρο το γονιδίωμα χωρίζεται σε μικρά θραύσματα για αλληλούχιση.
Η αλληλούχιση είναι μια σημαντική τεχνική στις μοριακές διεργασίες, ειδικά στην ακριβή ταυτοποίηση των ειδών. Στην πραγματικότητα, είναι η τεχνική αναγνώρισης της ακριβούς σειράς των νουκλεοτιδίων σε ένα γονίδιο ή ένα γονιδίωμα. Υπάρχουν πολλές τεχνικές για την αλληλουχία. Μερικά από αυτά περιλαμβάνουν τη μέθοδο Maxam Gilbert, τη μέθοδο Sanger και την αυτοματοποιημένη μέθοδο Sanger.
Τι είναι η ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων;
Η ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων είναι μία μέθοδος αλληλούχισης. Ονομάζεται επίσης «αλληλουχία από πάνω προς τα κάτω». Επιπλέον, αυτή η μέθοδος αποτελείται από δύο στάδια: το πρώτο βήμα είναι η ενίσχυση του γονιδιώματος και το δεύτερο στάδιο είναι ο κατακερματισμός του γονιδιώματος. Σε αυτή τη μέθοδο, το γονιδίωμα τεμαχίζεται πρώτα σε μεγάλα θραύσματα. Ακολουθεί η κλωνοποίηση αυτών των μεγάλων θραυσμάτων σε διάφορους ξενιστές χρησιμοποιώντας φορείς ή τεχνητά χρωμοσώματα. Στη συνέχεια, αυτοί οι ανασυνδυασμένοι φορείς διατάσσονται σε μια βιβλιοθήκη. Κατά τη διάρκεια της αλληλουχίας του κυνηγετικού όπλου, οι κλώνοι ανασυνδυασμένου φορέα υποβάλλονται σε προσδιορισμό αλληλουχίας ξεχωριστά. Τα θραύσματα στους κλώνους υφίστανται περιοριστική πέψη για να μειωθεί περαιτέρω το μέγεθος του γονιδιώματος, υποβάλλοντας έτσι τον προσδιορισμό της αλληλουχίας.
Εικόνα 01: Ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικού όπλου
Κατά την ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων, τα μεγάλα κομμάτια των θραυσμάτων πρέπει να τακτοποιηθούν με τη σειρά, πριν από την αλληλουχία του κυνηγετικού όπλου. Πραγματοποιείται με τη βοήθεια των μοριακών δεικτών που ενσωματώνονται κατά τη διαδικασία της κλωνοποίησης.
Η ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων δημιουργεί έναν χάρτη γονιδίων χαμηλής ανάλυσης. Αλλά δημιουργεί έναν ταξινομημένο χάρτη ακολουθίας. Έτσι, χρειάζεται μεγαλύτερη διάρκεια από την άμεση αλληλουχία. Η όλη διαδικασία καθυστερεί λόγω της δημιουργίας μιας βιβλιοθήκης ανασυνδυασμένων διανυσμάτων. Είναι επίσης μια τεχνική έντασης εργασίας. Ωστόσο, προς το παρόν, η τεχνική είναι αυτοματοποιημένη για να διευκολύνει την εργασία.
Τι είναι η αλληλουχία κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος;
Ο προσδιορισμός της αλληλουχίας του κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος είναι μια διαδικασία προσδιορισμού αλληλουχίας ενός σταδίου. Σε αυτή τη διαδικασία, ολόκληρη η διάτμηση του γονιδιώματος λαμβάνει χώρα πρώτα. Μετά από αυτό, καθένα από αυτά τα μικρά θραύσματα υφίσταται τυχαία αλληλουχία. Με την ολοκλήρωση της αλληλουχίας πραγματοποιείται η ανάλυση αλληλουχιών. Κατά τη διάρκεια της ανάλυσης αλληλουχίας, οι αλληλοκαλυπτόμενες αλληλουχίες αφαιρούνται και η ανάλυση δεν είναι μια διατεταγμένη διαδικασία. Επομένως, η συναρμολόγηση των ακολουθιών είναι μια λιγότερο αποτελεσματική διαδικασία σε σύγκριση με την ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων. Ωστόσο, η διαδικασία προσδιορισμού της αλληλουχίας του κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος είναι πιο γρήγορη και η ανάλυση ολόκληρου του γονιδιώματος μπορεί να πραγματοποιηθεί σε μία μόνο περίπτωση.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικού όπλου;
- Η ιεραρχική αλληλουχία και η αλληλουχία κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος είναι δύο προσεγγίσεις αλληλουχίας.
- Και τα δύο υποβάλλονται σε αλληλουχία Sanger ή αυτοματοποιημένες μεθόδους αλληλουχίας Sanger.
- Συμμετέχουν στον προσδιορισμό της αλληλουχίας θραυσμάτων DNA και RNA.
- Επιπλέον, και οι δύο μέθοδοι είναι σημαντικές για μοριακούς διαγνωστικούς και ερευνητικούς σκοπούς.
- Προς το παρόν, και οι δύο τεχνικές είναι αυτοματοποιημένες ή βασισμένες σε υπολογιστή.
- Και οι δύο τεχνικές βασίζονται στον κατακερματισμό του γονιδιώματος.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικού όπλου;
Η ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων δημιουργεί θραύσματα μεγαλύτερου μεγέθους σε σύγκριση με την αλληλουχία κυνηγετικών όπλων ολόκληρου του γονιδιώματος, η οποία λειτουργεί με μικρά θραύσματα αλληλουχιών. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικών όπλων γονιδιώματος. Επιπλέον, η ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων αποτελείται από δύο κύρια βήματα, ενώ η αλληλουχία κυνηγετικών όπλων ολόκληρου του γονιδιώματος βασίζεται σε ένα σημαντικό βήμα.
Επιπλέον, μια άλλη διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικών όπλων είναι ότι η ανάλυση είναι υψηλότερη στην αλληλουχία κυνηγετικών όπλων ολόκληρου του γονιδιώματος σε σύγκριση με την ιεραρχική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων.
Το παρακάτω infographic συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικού όπλου.
Σύνοψη – Ιεραρχική έναντι Ολόκληρου Γονιδιώματος Αλληλουχία κυνηγετικού όπλου
Η ιεραρχική αλληλουχία και η αλληλουχία κυνηγετικών όπλων ολόκληρου του γονιδιώματος είναι δύο τεχνικές για την αλληλουχία μεγάλων γονιδιωμάτων. Η ιεραρχική ακολουθία κυνηγετικών όπλων είναι μια διαδικασία αλληλούχισης δύο σταδίων όπου το γονιδίωμα διασπάται σε μεγαλύτερα θραύσματα. Αντίθετα, η αλληλουχία του κυνηγετικού όπλου ολόκληρου του γονιδιώματος είναι η αλληλουχία ενός μόνο σταδίου όπου το γονιδίωμα διασπάται σε μικρά θραύσματα και προσδιορίζεται απευθείας η αλληλουχία. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ ιεραρχικής και ολικής αλληλουχίας κυνηγετικών όπλων γονιδιώματος. Επιπλέον, οι τεχνικές πτυχές μπορεί να διαφέρουν μεταξύ των δύο τεχνικών.
