Η βασική διαφορά μεταξύ θειοκυανικής γουανιδίνης και υδροχλωρικής γουανιδίνης είναι ότι η θειοκυανική γουανιδίνη είναι ένα ισχυρότερο μετουσιωτή πρωτεΐνης που χρησιμοποιείται πιο συχνά στην απομόνωση RNA, ενώ η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι ένα ασθενέστερο μετουσιωτή πρωτεΐνης που χρησιμοποιείται λιγότερο συχνά στην απομόνωση RNA.
Μετουσίωση είναι η διαδικασία κατά την οποία οι πρωτεΐνες χάνουν την τεταρτοταγή δομή, την τριτοταγή δομή και τη δευτεροταγή δομή τους που κανονικά υπάρχει στη φυσική τους κατάσταση. Μπορεί να γίνει με την εφαρμογή κάποιου εξωτερικού στρες ή ενώσεων όπως ένα ισχυρό οξύ ή βάση, ένα συμπυκνωμένο ανόργανο άλας, ένας οργανικός διαλύτης (αλκοόλη, χλωροφόρμιο), ανάδευση, ακτινοβολία ή θερμότητα. Η θειοκυανική γουανιδίνη και η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι δύο διαφορετικοί τύποι μετουσιωτών πρωτεϊνών.
Τι είναι η θειοκυανική γουανιδίνη;
Η θειοκυανική γουανιδίνη (GTC) είναι ένας ισχυρότερος παράγοντας μετουσίωσης πρωτεΐνης που χρησιμοποιείται πιο συχνά στην απομόνωση RNA. Είναι επίσης γνωστό ως ισοθειοκυανικό γουανιδίνιο (GITC). Όντας ένας χαοτροπικός παράγοντας, είναι μια χημική ένωση που χρησιμοποιείται συνήθως ως γενικός μετουσιωτή πρωτεΐνης. Ένας χαοτροπικός παράγοντας είναι ένα μόριο σε ένα διάλυμα νερού που μπορεί να διαταράξει το δίκτυο δεσμών υδρογόνου μεταξύ των μορίων του νερού. Αυτό έχει επίδραση στη σταθερότητα της φυσικής κατάστασης άλλων μορίων στο διάλυμα, όπως μακρομόρια όπως πρωτεΐνες και νουκλεϊκά οξέα, εξασθενώντας το υδρόφοβο αποτέλεσμα. Οι χαοτροπικοί παράγοντες όπως η θειοκυανική γουανιδίνη μειώνουν την ποσότητα τάξης στη δομή της πρωτεΐνης που σχηματίζεται από μόρια νερού τόσο σε όγκο όσο και στα κελύφη ενυδάτωσης γύρω από τα υδρόφοβα αμινοξέα. Αυτό μπορεί να προκαλέσει μετουσίωση πρωτεΐνης.
Η θειοκυανική γουανιδίνη μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την απενεργοποίηση ιών όπως η γρίπη που προκαλούν ασθένειες όπως η ισπανική γρίπη το 1918. Ως εκ τούτου, μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε ιατρικές ή νοσοκομειακές εγκαταστάσεις. Επιπλέον, η θειοκυανική γουανιδίνη χρησιμοποιείται επίσης για τη λύση κυττάρων και σωματιδίων ιών σε εκχυλίσεις RNA και DNA. Εδώ, η λειτουργία της θειοκυανικής γουανιδίνης είναι να βοηθά τη δράση λύσης και να αποτρέπει τη δραστηριότητα των ενζύμων RNase και των ενζύμων DNase με μετουσίωση. Αυτά τα ένζυμα διαφορετικά θα βλάψουν το εκχύλισμα (RNA ή DNA).
Τι είναι η Υδροχλωρική Γουανιδίνη;
Η υδροχλωρική γουανιδίνη (GdnHCl) είναι ένα ασθενέστερο πρωτεϊνικό μετουσιωτικό που χρησιμοποιείται λιγότερο συχνά στην απομόνωση RNA. Είναι επίσης γνωστό ως χλωριούχο γουανιδίνιο (GdmCl). Είναι το υδροχλωρικό άλας της γουανιδίνης. Η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι χαοτροπική και ένα από τα μετουσιωτικά που χρησιμοποιούνται στις φυσικοχημικές μελέτες αναδίπλωσης πρωτεϊνών.
Εικόνα 01: Υδροχλωρική Γουανιδίνη
Η υδροχλωρική γουανιδίνη έχει επίσης την ικανότητα να μειώνει τη δραστηριότητα των ενζύμων και να αυξάνει τη διαλυτότητα των υδρόφοβων μορίων. Κανονικά, σε υψηλότερες συγκεντρώσεις υδροχλωρικής γουανιδίνης, οι πρωτεΐνες χάνουν τη διατεταγμένη δομή τους. Οι πρωτεΐνες τείνουν να τυλίγονται τυχαία σε αυτή τη συγκέντρωση υδροχλωρικής γουανιδίνης. Σε ιατρικές ή νοσοκομειακές ρυθμίσεις, η υδροχλωρική γουανιδίνη ενδείκνυται για τη μείωση των συμπτωμάτων της μυϊκής αδυναμίας και της εύκολης κόπωσης που σχετίζονται με τη νόσο σύνδρομο Eaton-Lambert. Επιπλέον, οι παρενέργειες της χρήσης υδροχλωρικής γουανιδίνης μπορεί να περιλαμβάνουν περισταλτισμό, διάρροια και θανατηφόρα καταστολή του μυελού των οστών.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ της θειοκυανικής γουανιδίνης και της υδροχλωρικής γουανιδίνης;
- Η θειοκυανική γουανιδίνη και η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι δύο διαφορετικοί τύποι μετουσιωτικών πρωτεϊνών.
- Και τα δύο μετουσιωτικά έχουν γουανιδίνη στη δομή τους.
- Είναι χαοτροπικοί παράγοντες.
- Μπορούν να χρησιμοποιηθούν και τα δύο μετουσιωτικά για την απομόνωση RNA.
- Χρησιμοποιούνται και τα δύο σε ιατρικές ή νοσοκομειακές εγκαταστάσεις.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ θειοκυανικής γουανιδίνης και υδροχλωρικής γουανιδίνης;
Η θειοκυανική γουανιδίνη είναι ένας ισχυρότερος μετουσιωτικός παράγοντας πρωτεϊνών που χρησιμοποιείται πιο συχνά στην απομόνωση RNA, ενώ η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι ένα ασθενέστερο μετουσιωτή πρωτεΐνης που χρησιμοποιείται λιγότερο συχνά στην απομόνωση RNA. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ της θειοκυανικής γουανιδίνης και της υδροχλωρικής γουανιδίνης. Επιπλέον, ο χημικός τύπος της θειοκυανικής γουανιδίνης είναι C2H6N4S, ενώ ο χημικός τύπος της υδροχλωρικής γουανιδίνης είναι CH5N3HCl.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τις διαφορές μεταξύ θειοκυανικής γουανιδίνης και υδροχλωρικής γουανιδίνης σε μορφή πίνακα για σύγκριση.
Σύνοψη – Θειοκυανική Γουανιδίνη εναντίον Υδροχλωρικής Γουανιδίνης
Η θειοκυανική γουανιδίνη και η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι δύο διαφορετικοί τύποι μετουσιωτικών πρωτεϊνών. Και τα δύο μετουσιωτικά είναι χαοτροπικά. Η θειοκυανική γουανιδίνη είναι ένας ισχυρότερος μετουσιωτικός παράγοντας πρωτεΐνης που χρησιμοποιείται πιο συχνά στην απομόνωση RNA, ενώ η υδροχλωρική γουανιδίνη είναι ένα ασθενέστερο πρωτεϊνικό μετουσιωτικό που χρησιμοποιείται λιγότερο συχνά στην απομόνωση RNA. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ θειοκυανικής γουανιδίνης και υδροχλωρικής γουανιδίνης.
