Η βασική διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα είναι ότι το μοτίβο δεν είναι ανεξάρτητα σταθερό ενώ ο τομέας είναι ανεξάρτητα σταθερό.
Οι πρωτεΐνες είναι σημαντικά βιολογικά μακρομόρια που υπάρχουν στο σώμα μας. Από την άλλη πλευρά, ο γενετικός κώδικας ενός γονιδίου θα καθορίσει την αλληλουχία αμινοξέων μιας πρωτεΐνης. Επιπλέον, οι πρωτεΐνες έχουν πρωτογενείς, δευτερογενείς και τριτοταγείς δομές. Η πρωταρχική δομή είναι η αλληλουχία αμινοξέων της πολυπεπτιδικής αλυσίδας. Όταν οι πολυπεπτιδικές αλυσίδες διπλώνουν μεταξύ τους, σχηματίζεται η δευτερογενής δομή της πρωτεΐνης. Οι άλφα έλικες, τα φύλλα βήτα και οι υπερ-δευτερεύουσες δομές ανήκουν στις δευτερεύουσες δομές. Ορισμένες ομάδες υπερ-δευτερογενών στοιχείων είναι γνωστές ως πρωτεϊνικά μοτίβα. Η τριτογενής δομή μιας πρωτεΐνης αναφέρεται στην τρισδιάστατη δομή της που καθορίζει τη λειτουργία της πρωτεΐνης. Ο τομέας είναι ένα διπλωμένο τμήμα ενός μορίου πρωτεΐνης, το οποίο είναι σφαιρικό και έχει μια διακριτή λειτουργία. Είναι η θεμελιώδης λειτουργική και τρισδιάστατη δομή της πρωτεΐνης.
Τι είναι το μοτίβο;
Το Μοτίβο είναι μια ορισμένη ομαδοποίηση των υπερδευτερογενών στοιχείων πρωτεϊνών όπως οι άλφα έλικες και οι δομές βήτα. Είναι κάποιο είδος μοτίβων που υπάρχουν σε διαφορετικές πρωτεΐνες. Τα μοτίβα περιγράφουν τα μοτίβα αναδίπλωσης των δευτερευόντων δομικών στοιχείων και τις αλληλεπιδράσεις τους. Αυτά τα σχέδια αναδίπλωσης σταθεροποιούνται με παρόμοιους δεσμούς που υπάρχουν σε τριτογενείς δομές. Ωστόσο, δεν είναι τόσο περίπλοκες όσο οι τριτογενείς δομές.
Εικόνα 01: Μοτίβο
Είναι απλοί συνδυασμοί δευτερογενών δομών πρωτεϊνών. Το μοτίβο δεν είναι σταθερό από μόνο του. Επιπλέον, τα μοτίβα εξηγούν τη δομή μιας πρωτεΐνης αλλά δεν προβλέπουν τη λειτουργία μιας πρωτεΐνης. Παραδείγματα μοτίβων πρωτεΐνης είναι ένα μοτίβο βήτα-άλφα-βήτα, μοτίβο ελληνικό κλειδί, βαρέλι βήτα, μοτίβο βήτα-μαιάνδρου, κ.λπ.
Τι είναι το Domain;
Το Ο τομέας είναι μια θεμελιώδης, λειτουργική και τρισδιάστατη μονάδα μιας πρωτεΐνης. Εκτελεί μια συγκεκριμένη λειτουργία. Μια μεμονωμένη πρωτεΐνη μπορεί να έχει πολλούς διακριτούς τομείς. Κάθε τομέας είναι μια ανεξάρτητη μονάδα. Είναι μια σφαιρική δομή. Είναι υπεύθυνο για μια συγκεκριμένη λειτουργία ή αλληλεπίδραση. Οι τομείς μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να υποθέσουμε τη λειτουργία μιας αχαρακτήριστης πρωτεΐνης. Κατά την ανάλυση μιας πρωτεΐνης, είναι απαραίτητο να λαμβάνεται υπόψη, καθώς οι τομείς είναι οι λειτουργικές μονάδες της πρωτεΐνης.
Εικόνα 02: Τρεις διαφορετικοί τομείς πυροσταφυλικής κινάσης
Οι τομείς είναι πολύ σταθερές και συμπαγείς δομές. Διακρίνονται εύκολα από άλλες περιοχές. Η πυροσταφυλική κινάση έχει τρεις διακριτές περιοχές όπως φαίνεται στο σχήμα 02. Το μήκος της περιοχής μπορεί να ποικίλλει και το μέσο μήκος είναι 100 αμινοξέα. Κάθε τομέας περιέχει έναν υδρόφοβο πυρήνα κατασκευασμένο από δευτερεύουσες δομικές μονάδες. Αρκετοί τομείς σχηματίζουν συλλογικά την τριτοταγή δομή μιας πρωτεΐνης.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ μοτίβου και τομέα;
- Το μοτίβο και ο τομέας είναι μονάδες που υπάρχουν στα ίδια τα μόρια πρωτεΐνης.
- Είναι χρήσιμες κατά την ταξινόμηση των οικογενειών πρωτεϊνών.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα;
Το Μοτίβο είναι μια ορισμένη ομαδοποίηση των υπερδευτερογενών στοιχείων πρωτεϊνών, όπως οι άλφα έλικες και οι δομές βήτα, ενώ ο τομέας είναι η λειτουργική μονάδα μιας πρωτεΐνης. Επιπλέον, το μοτίβο είναι μια δευτερεύουσα δομή ενώ η περιοχή είναι υπεύθυνη για την τριτοταγή δομή της πρωτεΐνης. Επιπλέον, ο τομέας είναι μια ανεξάρτητη μονάδα, σε αντίθεση με ένα μοτίβο. Επίσης, ο τομέας απεικονίζει τη λειτουργία μιας πρωτεΐνης ενώ το μοτίβο όχι. Αυτές είναι οι κύριες διαφορές μεταξύ μοτίβου και τομέα. Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τη διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα σε μορφή πίνακα.
Σύνοψη – Μοτίβο εναντίον Τομέα
Το Μοτίβο είναι μια διάταξη δευτερογενών δομών του μορίου πρωτεΐνης. Δεν είναι συνήθως σταθερό από μόνο του, σε αντίθεση με έναν τομέα. Ο τομέας είναι μια ανεξάρτητα σταθερή δομή μιας πρωτεΐνης. Επομένως, μπορεί να είναι μέρος ή ολόκληρο μόριο πρωτεΐνης. Είναι μια τρισδιάστατη θεμελιώδης λειτουργική μονάδα της πρωτεΐνης. Επιπλέον, έχει μια λειτουργία και είναι μια ανεξάρτητη μονάδα. Το μοτίβο μπορεί να είναι μέρος του τομέα. Αλλά ο τομέας δεν μπορεί να είναι μέρος ενός μοτίβου. Αυτή είναι η διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα.
