Η βασική διαφορά μεταξύ dATP και ddATP είναι ότι το dATP δεν τερματίζει τη σύνθεση DNA ενώ το ddATP είναι σε θέση να τερματίσει τη σύνθεση DNA. Αυτό συμβαίνει επειδή το ddATP έχει ένα άτομο Η συνδεδεμένο στη θέση 3' του σακχάρου πεντόζης ενώ το dATP έχει μια ομάδα ΟΗ συνδεδεμένη στη θέση 3'.
Τα dNTP είναι δομικά στοιχεία του DNA. Υπάρχουν τέσσερις τύποι dNTP σύμφωνα με τις βάσεις πουρίνης ή πυριμιδίνης - dATP ένας από αυτούς. Η αζωτούχα βάση του dATP είναι η αδενοσίνη. Τα ddNTPs είναι νουκλεοτίδια που χρησιμοποιούνται στον προσδιορισμό της αλληλουχίας Sanger. Υπάρχουν τέσσερις τύποι ddNTP. Το ddATP είναι ένα ddNTP.
Τι είναι το dATP;
Η τριφωσφορική δεοξυαδενοσίνη είναι ένα νουκλεοτίδιο, το οποίο είναι ένα δομικό στοιχείο του DNA. Το ένζυμο πολυμεράσης DNA χρησιμοποιεί το dATP ως υπόστρωμα για τη σύνθεση του DNA. Το dATP έχει τρία συστατικά: ένα μόριο σακχάρου δεοξυριβόζης, μια αδενοσίνη και τις τρεις φωσφορικές ομάδες. Επομένως, είναι ένας τριφωσφορικός νουκλεοζίτης πουρίνης. Ο χημικός τύπος του dATP είναι C10H16N5O12 P3, και η μοριακή του μάζα είναι 491,182.
Εικόνα 01: dATP
Το dATP διαφέρει από το ATP (τριφωσφορική αδενοσίνη) όσον αφορά τα συστατικά σακχάρου. Το ATP έχει σάκχαρο ριβόζης. Το dATP ζεύγη βάσεων με το νουκλεοτίδιο ουρακίλης κατά τη διάρκεια της μεταγραφής. Εκτός από τη συμμετοχή στη σύνθεση του DNA, το dATP μπορεί να λειτουργήσει ως μόριο μεταφοράς ενέργειας για να διατηρήσει επίσης τη βιωσιμότητα των κυττάρων. Ένα υψηλό επίπεδο dATP στο σώμα είναι τοξικό καθώς μπορεί να λειτουργήσει ως μη ανταγωνιστικός αναστολέας για το ένζυμο ριβονουκλεοτιδική αναγωγάση. Μπορεί να οδηγήσει σε εξασθενημένη λειτουργία του ανοσοποιητικού.
Τι είναι το ddATP;
Η τριφοαφική διδεοξυαδενοσίνη ή ddATP είναι ένας από τους τέσσερις τύπους νουκλεοτιδίων που χρησιμοποιούνται στη μέθοδο προσδιορισμού αλληλουχίας Sanger. Δομικά, το ddATP έχει επίσης τρία στοιχεία παρόμοια με το dATP. Είναι μια βάση αδενίνης, ένα σάκχαρο δεοξυριβόζης και τρία φωσφορικά.
Εικόνα 02: ddATP
Σε αντίθεση με το dATP, το ddATP στερείται μιας ομάδας ΟΗ στη θέση 3' του σακχάρου της πεντόζης προκειμένου να σχηματίσει φωσφοδιεστερικό δεσμό με το γειτονικό νουκλεοτίδιο και να συνεχίσει την επιμήκυνση της αλυσίδας. Έχει ένα άτομο Η στη θέση 3'. Επομένως, μόλις ενσωματωθεί το ddATP, η σύνθεση DNA τελειώνει. Είναι η βασική αρχή της αλληλουχίας Sanger. Επομένως, το ddATP λειτουργεί ως αναστολέας επιμήκυνσης αλυσίδας στην αλληλουχία Sanger. Υπάρχουν τέσσερις σωλήνες που χρησιμοποιούνται στην αλληλουχία Sanger και το ddATP προστίθεται σε έναν σωλήνα.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ dATP και ddATP;
- dATP και ddATP είναι νουκλεοτίδια.
- Και τα δύο αποτελούνται από αδενίνη, δεοξυριβόζη και τρία φωσφορικά.
- Είναι οργανικές ενώσεις.
- Τόσο το dATP όσο και το ddATP προστίθενται σε σωλήνες με αλληλουχία Sanger.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ dATP και ddATP;
Το dATP έχει μια ομάδα ΟΗ στη θέση 3' του σακχάρου πεντόζης, ενώ το ddATP δεν έχει μια ομάδα ΟΗ στη θέση 3' του σακχάρου πεντόζης. Επιπλέον, το dATP είναι ένα μονομερές που χρησιμοποιείται στη σύνθεση DNA ενώ το ddATP χρησιμοποιείται για τον τερματισμό της επιμήκυνσης της αλυσίδας κατά τη διάρκεια της αλληλουχίας Sanger. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ dATP και ddATP. Επιπλέον, το dATP μπορεί να σχηματίσει φωσφοδιεστερικούς δεσμούς ενώ το ddATP δεν μπορεί να σχηματίσει φωσφοδιεστερικούς δεσμούς.
Το παρακάτω infographic δείχνει περισσότερες διαφορές μεταξύ dATP και ddATP σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – dATP vs ddATP
Συνοπτικά, το dATP είναι πρόδρομος της σύνθεσης DNA ενώ το ddATP είναι ένα νουκλεοτίδιο που χρησιμοποιείται για τον τερματισμό της σύνθεσης DNA στον προσδιορισμό αλληλουχίας Sanger. Επιπλέον, το dATP έχει μια ομάδα ΟΗ στη θέση 3' του σακχάρου πεντόζης και επιτρέπει το σχηματισμό ενός φωσφοδιεστερικού δεσμού με το επόμενο νουκλεοτίδιο. Εν τω μεταξύ, το ddATP στερείται ομάδας ΟΗ στη θέση 3ʹ. Ως εκ τούτου, δεν είναι σε θέση να σχηματίσει φωσφοδιεστερικό δεσμό με το επόμενο νουκλεοτίδιο. Ως αποτέλεσμα, η αλληλουχία DNA σταματά την επιμήκυνσή της. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ dATP και ddATP.
