Η βασική διαφορά μεταξύ συνδετήρα και προσαρμογέα είναι ότι ένας σύνδεσμος δεν έχει συνεκτικά άκρα ενώ ένας προσαρμογέας έχει ένα συνεκτικό άκρο.
Η σύνδεση DNA είναι η διαδικασία ένωσης δύο μορίων DNA μεταξύ τους, σχηματίζοντας φωσφοδιεστερικούς δεσμούς. Το ένζυμο που ονομάζεται λιγκάση DNA καταλύει αυτήν την αντίδραση. Είναι ένα από τα κρίσιμα βήματα σε σύγχρονα μοριακά βιολογικά πεδία όπως η τεχνολογία ανασυνδυασμένου DNA και η κλωνοποίηση DNA. Η αποτελεσματικότητα της απολίνωσης εξαρτάται από τα άκρα των μορίων DNA που πρόκειται να απολινωθούν. Υπάρχουν δύο τύποι άκρων DNA ως κολλώδη άκρα και αμβλέα άκρα. Η αποτελεσματικότητα της απολίνωσης είναι υψηλή με τα κολλώδη άκρα παρά με τα αμβλέα άκρα. Εάν τα μόρια DNA-στόχοι έχουν αμβλεία άκρα, τα μόρια που ονομάζονται προσαρμογείς ή συνδετήρες θα είναι χρήσιμα. Οι προσαρμογείς και οι συνδέτες είναι χημικά συντιθέμενα μόρια ολιγονουκλεοτιδίων που βοηθούν στην απολίνωση του DNA. Έχουν επίσης εσωτερικούς χώρους περιορισμού. Ο προσαρμογέας έχει ένα κολλώδες άκρο και ένα αμβλύ άκρο, ενώ ο σύνδεσμος έχει δύο αμβλεία άκρα.
Τι είναι ένας σύνδεσμος;
Το Linker είναι μια χημικά συντιθέμενη ολιγονουκλεοτιδική αλληλουχία που είναι δίκλωνη. Το Linker έχει δύο αμβλεία άκρα. Ο συνδετήρας χρησιμοποιείται για τη σύνδεση μορίων DNA που έχουν αμβλύ άκρο σε φορείς. Περιέχει έναν ή περισσότερους εσωτερικούς περιορισμούς. Αυτές οι θέσεις περιορισμού λειτουργούν ως θέσεις αναγνώρισης για ένζυμα περιορισμού.
Εικόνα 01: Σύνδεση
Μετά την απολίνωση, το DNA περιορίζεται ξανά με περιοριστικά ένζυμα για την παραγωγή συνεκτικών άκρων. Οι συνδέτες EcoRI και οι συνδέτες sal-I είναι συνήθως χρησιμοποιούμενοι συνδέτες.
Τι είναι ένας προσαρμογέας;
Ένας προσαρμογέας είναι μια δίκλωνη ολιγονουκλεοτιδική αλληλουχία που χρησιμοποιείται για τη σύνδεση δύο μορίων DNA μεταξύ τους. Είναι μια σύντομη ακολουθία με ένα αμβλύ άκρο και ένα κολλώδες ή συνεκτικό άκρο. Επομένως, αποτελείται από μια μονόκλωνη ουρά στο ένα άκρο, η οποία ενισχύει την αποτελεσματικότητα της απολίνωσης του DNA.
Εικόνα 02: Σύνδεση DNA από έναν προσαρμογέα
Επιπλέον, ο προσαρμογέας έχει εσωτερικές τοποθεσίες περιορισμού. Επομένως, μετά την απολίνωση, το DNA μπορεί να περιοριστεί με κατάλληλα περιοριστικά ένζυμα προκειμένου να δημιουργηθεί ένα νέο προεξέχον άκρο. Ένα μειονέκτημα των προσαρμογέων είναι ότι δύο προσαρμογείς μπορούν να σχηματίσουν ροοστάτες συνδέοντας τη βάση με τον εαυτό τους. Αυτό μπορεί να αποφευχθεί με τη θεραπεία τους με το ένζυμο που ονομάζεται αλκαλική φωσφατάση.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ του Linker και του Adaptor;
- Τόσο ο συνδέτης όσο και ο προσαρμογέας είναι δίκλωνες βραχείες ολιγονουκλεοτιδικές αλληλουχίες.
- Φέρουν ιστότοπους εσωτερικού περιορισμού.
- Επιπλέον, είναι χημικά συντιθέμενα μόρια DNA και είναι συνθετικά μόρια.
- Μπορούν να συνδέσουν δύο μόρια DNA μεταξύ τους.
- Μετά την απολίνωση των συνδετών και των προσαρμοστών, το DNA περιορίζεται και πάλι με περιοριστικά ένζυμα προκειμένου να παραχθούν κολλώδη άκρα.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Linker και Adaptor;
Ένας συνδέτης είναι ένα χημικά συντιθέμενο κοντό ολιγονουκλεοτιδικό διπλό με δύο αμβλεία άκρα. Ένας προσαρμογέας είναι ένα χημικά συντιθέμενο κοντό ολιγονουκλεοτιδικό διπλό με ένα κολλώδες άκρο και ένα αμβλύ άκρο. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ συνδετήρα και προσαρμογέα. Επιπλέον, οι προσαρμογείς μπορούν να σχηματίσουν διμερή, ενώ οι συνδετήρες δεν σχηματίζουν διμερή. Επομένως, αυτή είναι μια άλλη σημαντική διαφορά μεταξύ του συνδετήρα και του προσαρμογέα.
Ακολουθεί μια σύνοψη των διαφορών μεταξύ του συνδετήρα και του προσαρμογέα σε μορφή πίνακα.
Σύνοψη – Linker vs Adaptor
Ο σύνδεσμος και ο προσαρμογέας είναι δύο τύποι χημικά συντιθέμενων ολιγονουκλεοτιδίων που είναι χρήσιμοι για την απολίνωση του DNA αμβλέων άκρων. Το Linker έχει δύο αμβλεία άκρα, ενώ ο προσαρμογέας έχει ένα αμβλύ άκρο και ένα συνεκτικό άκρο. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ συνδέσμου και προσαρμογέα. Είναι δίκλωνα μόρια που έχουν εσωτερικές θέσεις περιορισμού. Χρησιμοποιούνται ευρέως στην τεχνολογία ανασυνδυασμένου DNA και στην κλωνοποίηση DNA.
