Η βασική διαφορά μεταξύ του DNA χωρίς κύτταρα και του κυκλοφορούντος DNA όγκου είναι ότι το DNA χωρίς κύτταρα είναι διάφορες μορφές DNA που κυκλοφορούν ελεύθερα στο αίμα ενώ το κυκλοφορούν DNA όγκου είναι το κατακερματισμένο DNA που προέρχεται από όγκο που κυκλοφορεί στο αίμα.
Το DNA χωρίς κύτταρα και το DNA του κυκλοφορούντος όγκου είναι δύο τύποι κυκλοφορούντων νουκλεϊκών οξέων. Τα κυκλοφορούντα νουκλεϊκά οξέα ανακαλύφθηκαν από τους Mandel and Metal το 1948. Αργότερα, ανακαλύφθηκε ότι η ποσότητα των κυκλοφορούντων νουκλεϊνικών οξέων σε ασθενείς ασθενείς είναι σημαντικά υψηλή. Αυτή η ανακάλυψη έγινε για πρώτη φορά σε σχέση με ασθενείς με λύκο. Επιπλέον, τα κυκλοφορούντα νουκλεϊκά οξέα έχουν υψηλότερη προγνωστική αξία και μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως βιοδείκτες για την ανίχνευση διαφόρων ασθενειών.
Τι είναι το DNA χωρίς κύτταρα;
Το Το DNA χωρίς κύτταρα (Cf DNA) αναφέρεται σε διάφορες μορφές DNA όπως το κυκλοφορούν DNA όγκου, το μιτοχονδριακό DNA χωρίς κύτταρα και το εμβρυϊκό DNA χωρίς κύτταρα κ.λπ., που κυκλοφορούν ελεύθερα στο αίμα. Τα αυξημένα επίπεδα DNA χωρίς κύτταρα παρατηρούνται σε προχωρημένες ασθένειες όπως ο καρκίνος, το τραύμα, η σήψη, το έμφραγμα του μυοκαρδίου, ο διαβήτης, το εγκεφαλικό επεισόδιο, η δρεπανοκυτταρική αναιμία κ.λπ. Εκτός από τον καρκίνο και την εμβρυϊκή ιατρική, το DNA χωρίς κύτταρα είναι ένας χρήσιμος βιοδείκτης για πλήθος παθήσεων. Αυτό το DNA μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την ανίχνευση απόρριψης μοσχεύματος μοσχεύματος. Χρησιμοποιούνται επίσης για τον προσδιορισμό του συνηθισμένου στρες, την προγεννητική διάκριση φύλου και τον έλεγχο πατρότητας.
Εικόνα 01: Χωρίς κύτταρα DNA
Ένα DNA χωρίς κύτταρα είναι συνήθως ένα δίκλωνο εξωκυτταρικό μόριο DNA. Αποτελείται από μικρά θραύσματα (50 έως 200 bp) και μεγαλύτερα θραύσματα (21 kb). Επιπλέον, έχει ήδη αναγνωριστεί ως αξιόπιστος βιοδείκτης για τη διάγνωση του καρκίνου του προστάτη και του μαστού. Το DNA χωρίς κύτταρα κυκλοφορεί κυρίως στην κυκλοφορία του αίματος ως νουκλεοσώματα. Τα νουκλεοσώματα είναι πυρηνικά σύμπλοκα ιστονών και DNA. Το Cf DNA μπορεί να ποσοτικοποιηθεί χρησιμοποιώντας διάφορες τεχνικές όπως PCR, μαζικά παράλληλη αλληλούχιση, φασματομετρία υπεριώδους, χρώση PicoGreen και ELISA. Καθώς η ανίχνευση Cf DNA στην κυκλοφορία του αίματος είναι μια γρήγορη, εύκολη, μη επεμβατική, επαναλαμβανόμενη μέθοδος, στο μέλλον θα είναι ένας πιθανός βιοδείκτης για τη διάγνωση πολλών ασθενειών όπως οι αυτοάνοσες ρευματικές παθήσεις και οι όγκοι.
Τι είναι το DNA του κυκλοφορούντος όγκου;
Το κυκλοφορούν DNA όγκου (Ct DNA) είναι το κατακερματισμένο DNA που προέρχεται από όγκο που κυκλοφορεί στο αίμα. Έχει προέλευση όγκου. Καθώς ένας κυκλοφορούμενος όγκος μπορεί να αντανακλά ολόκληρο το γονιδίωμα του όγκου, έχει κερδίσει μεγάλη έλξη για τη δυνητική του χρησιμότητα σε κλινικές εγκαταστάσεις. Οι υγρές βιοψίες, οι οποίες αντλούν αίμα, μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τον έλεγχο κυκλοφορούντων όγκων.
Εικόνα 02: Κυκλοφορούμενο DNA όγκου
Οι βιολογικές διεργασίες που πιθανώς εμπλέκονται στην απελευθέρωση Ct DNA περιλαμβάνουν απόπτωση και νέκρωση από κύτταρα που πεθαίνουν ή ενεργή απελευθέρωση από κύτταρα όγκου. Σε υγιείς ιστούς, τα διεισδυτικά φαγοκύτταρα μπορούν να καθαρίσουν το Ct DNA. Επιπλέον, διάφορες τεχνικές μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την ανάλυση του κυκλοφορούντος DNA όγκου, όπως η σταγονοειδής ψηφιακή PCR, η BEAMing, η CAPP-Seq (βαθιά αλληλουχία), η ασφαλής αλληλουχία και η διπλή αλληλουχία.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ DNA χωρίς κύτταρα και DNA κυκλοφορούντος όγκου;
- Το DNA χωρίς κύτταρα και το κυκλοφορούν DNA όγκου είναι δύο τύποι κυκλοφορούντων νουκλεϊκών οξέων.
- Αποτελούνται από νουκλεοτίδια.
- Και οι δύο τύποι μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως πιθανοί δείκτες για τη διάγνωση διαφόρων ασθενειών σε κλινικές εγκαταστάσεις.
- Βρίσκονται στην κυκλοφορία του αίματος.
- Και οι δύο είναι εξωκυτταρικές μορφές μορίων DNA.
- Καθαρίζονται και τα δύο με διείσδυση φαγοκυττάρων.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ DNA χωρίς κύτταρα και DNA κυκλοφορούντος όγκου;
Το DNA χωρίς κύτταρα είναι διάφορες μορφές DNA όπως κυκλοφορούν DNA όγκου, μιτοχονδριακό DNA χωρίς κύτταρα και εμβρυϊκό DNA χωρίς κύτταρα κ.λπ., που κυκλοφορούν ελεύθερα στο αίμα, ενώ το κυκλοφορούν DNA όγκου είναι το κατακερματισμένο DNA που προέρχεται από όγκο που κυκλοφορεί στο αίμα. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ του DNA χωρίς κύτταρα και του κυκλοφορούντος DNA όγκου. Επιπλέον, το DNA χωρίς κύτταρα κυκλοφορεί σε θραύσματα που κυμαίνονται από 50-220 bp ενώ το κυκλοφορούν DNA όγκου κυκλοφορεί σε θραύσματα που κυμαίνονται από 134-144 bp.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τη διαφορά μεταξύ DNA χωρίς κύτταρα και DNA όγκου που κυκλοφορεί σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – Χωρίς κύτταρα DNA έναντι DNA κυκλοφορούντος όγκου
Τα κυκλοφορούντα νουκλεϊκά οξέα ρίχνονται στην κυκλοφορία του αίματος μέσω ελεγχόμενων ή τυχαίων μηχανισμών. Το DNA χωρίς κύτταρα και το DNA του κυκλοφορούντος όγκου είναι δύο τύποι κυκλοφορούντων νουκλεϊκών οξέων. Το DNA χωρίς κύτταρα είναι διάφορες μορφές DNA όπως το κυκλοφορούν DNA όγκου, το μιτοχονδριακό DNA χωρίς κύτταρα, το εμβρυϊκό DNA χωρίς κύτταρα που κυκλοφορεί ελεύθερα στο αίμα ενώ το DNA του όγκου κυκλοφορεί είναι το κατακερματισμένο DNA που προέρχεται από τον όγκο που κυκλοφορεί στο αίμα. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ DNA χωρίς κύτταρα και DNA όγκου που κυκλοφορεί.
