Η βασική διαφορά μεταξύ cis και trans μάτισης είναι ότι το cis μάτισμα είναι ένας ενδομοριακός μηχανισμός που αφαιρεί εσώνια και ενώνει τα εξόνια που βρίσκονται εντός του ίδιου μεταγράφου RNA, ενώ το trans-splicing είναι ένας διαμοριακός μηχανισμός που αφαιρεί εσώνια ή άουτ και ενώνει τα εξόνια που δεν βρίσκονται εντός της ίδιας μεταγραφής RNA.
Το μάτισμα RNA είναι μια μορφή επεξεργασίας RNA πριν από τη σύνθεση πρωτεϊνών. Σε αυτή τη διαδικασία, ένα νέο μεταγραφικό RNA προ-αγγελιοφόρου μετασχηματίζεται σε ώριμο αγγελιοφόρο RNA. Το ώριμο αγγελιοφόρο RNA βοηθά στην παραγωγή ενός μορίου πρωτεΐνης. Κατά το μάτισμα του RNA, τα ιντρόνια (μη κωδικοποιητικές περιοχές) αφαιρούνται και τα εξόνια (περιοχές κωδικοποίησης) ενώνονται μεταξύ τους για να δημιουργήσουν ώριμο mRNA. Το Cis και το trans μάτισμα είναι δύο τύποι μηχανισμών ματίσματος RNA.
Τι είναι το Cis Splicing;
Το Το μάτισμα Cis είναι ένας ενδομοριακός μηχανισμός που αφαιρεί τα ιντρόνια και ενώνει τα εξόνια που βρίσκονται εντός του ίδιου μεταγράφου RNA. Το κανονικό μάτισμα cis επεξεργάζεται ένα μόνο μόριο RNA. Το μάτισμα Cis είναι η τυπική διαδικασία ματίσματος του pre mRNA που πραγματοποιείται από ματίσματα. Στο εσώνιο, μια θέση δότη (5' άκρο του ιντρονίου), μια θέση διακλάδωσης (κοντά στο 3' άκρο του ιντρονίου) και μια θέση δέκτη (3' άκρο του ιντρονίου) είναι εξαιρετικά απαραίτητα για το μάτισμα. Η θέση δότη ματίσματος περιλαμβάνει μια αμετάβλητη ακολουθία GU στο 5' άκρο του εσωνίου. Η θέση δέκτη ματίσματος στο 3' άκρο του ιντρονίου έχει μια αμετάβλητη ακολουθία AG. Ανοδικά από την αλληλουχία AG, υπάρχει μια περιοχή που ονομάζεται περιοχή πυριμιδίνης (οδός πολυπυριμιδίνης). Περαιτέρω ανάντη από την οδό πολυπυριμιδίνης, υπάρχει ένα σημείο διακλάδωσης που περιλαμβάνει ένα νουκλεοτίδιο αδενοσίνης. Αυτό το νουκλεοτίδιο εμπλέκεται στο σχηματισμό λαριάτων.
Εικόνα 01: Συναρμολόγηση Cis και Trans
Τα κύρια ματοσώματα είναι τα U1, U2, U4, U5 και U6. Μεταξύ αυτών, το U1 και το U2 είναι πολύ σημαντικά. Στο cis μάτισμα, το U1 συνδέεται στη θέση ματίσματος 5' και το U2 συνδέεται στο σημείο διακλάδωσης κοντά στη θέση ματίσματος 3'. Το U5/U4/U6 δεσμεύει εξόνια στη θέση 5', με το U6 να συνδέεται με το U2. Αργότερα κυκλοφορεί το U1. Το U5 μετατοπίζεται από το εξόνιο στο εσώνιο και το U6 συνδέεται στη θέση ματίσματος 5'. Επιπλέον, κυκλοφορεί και το U4. Το U6/U2 καταλύει τη μετεστεροποίηση, καθιστώντας το 5' άκρο του ιντρονίου να συνδέεται με το νουκλεοτίδιο Α στο εσώνιο. Αυτό ενεργοποιεί το σχηματισμό λαριάτων. Κατά το σχηματισμό ενός λαρυγγίου, το U5 δεσμεύει το εξόνιο στη θέση ματίσματος 3' και η θέση 5' διασπάται. Στην τελική φάση του ματίσματος, τα U2/U5/U6 παραμένουν συνδεδεμένα με το λαριάτιο και η θέση 3' αποκόπτεται. Επιπλέον, τα εξόνια συνδέονται με υδρόλυση ΑΤΡ σε αυτή τη φάση.
Τι είναι το Trans Splicing;
Το τρανς μάτισμα είναι ένας διαμοριακός μηχανισμός που αφαιρεί εσώνια ή εξώνια και ενώνει τα εξόνια που δεν βρίσκονται εντός του ίδιου μεταγράφου RNA. Στο trans-μάτισμα, δεν υπάρχει θέση ματίσματος 5' στο μόριο pre mRNA για να συνδεθεί η πρωτεΐνη U1. Αντίθετα, το RNA οδηγού συναρμογής (SL) με κάλυψη μετατοπίζεται σε αλληλουχία στο outron.
Εικόνα 02: Trans Splicing
Το Outron είναι μια περιοχή του pre mRNA μεταξύ του καλύμματος 5' και της θέσης ματίσματος trans. Ωστόσο, η πρωτεΐνη U2 συνδέεται συνήθως με τη θέση ματίσματος 3'. Μετά την αφαίρεση του outron, το εξόνιο οδηγού ματίσματος (SL) ματίζεται στο πρώτο εξόνιο στο pre mRNA. Επιπλέον, το trans-splicing είναι ένας μηχανισμός που παρατηρείται σε ορισμένους μικροοργανισμούς όπως οι πρωτεΐνες της κατηγορίας Kinetoplastae για την έκφραση γονιδίων.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ Cis και Trans Splicing;
- Το μάτισμα Cis και trans είναι δύο τύποι μηχανισμών ματίσματος RNA.
- Και στους δύο μηχανισμούς, τα εσώνια αφαιρούνται.
- Επίσης, και στους δύο μηχανισμούς, τα εξόνια ενώνονται για να σχηματίσουν ώριμο mRNA.
- Και οι δύο μηχανισμοί βρίσκονται στους ευκαρυώτες.
- Αυτοί οι μηχανισμοί απουσιάζουν στους προκαρυώτες.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Cis και Trans Splicing;
Το μάτισμα Cis είναι ένας ενδομοριακός μηχανισμός που αφαιρεί τα ιντρόνια και ενώνει τα εξόνια που βρίσκονται εντός του ίδιου μεταγραφήματος RNA, ενώ το trans-splicing είναι ένας διαμοριακός μηχανισμός που αφαιρεί εσώνια ή εξόνια και ενώνει τα εξόνια που δεν βρίσκονται μέσα στο ίδιο RNA αντίγραφο. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ cis και trans μάτισης. Επιπλέον, στο μάτισμα cis, τα ιντρόνια αφαιρούνται για να σχηματίσουν ώριμο mRNA. Από την άλλη πλευρά, στο trans μάτισμα αφαιρούνται εσώνια ή άουτρον για να σχηματιστεί ώριμο mRNA.
Το παρακάτω infographic παραθέτει τις διαφορές μεταξύ cis και trans μάτισης σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – Cis vs Trans Splicing
Το Το μάτισμα RNA είναι μια μορφή επεξεργασίας RNA πριν από τη διαδικασία πρωτεϊνοσύνθεσης. Το Cis και το trans μάτισμα είναι δύο τύποι μηχανισμών ματίσματος RNA που βρίσκονται στους ευκαρυώτες. Το μάτισμα Cis είναι ένας ενδομοριακός μηχανισμός που αφαιρεί ιντρόνια και ενώνει τα εξόνια που βρίσκονται εντός του ίδιου μεταγράφου RNA, ενώ το trans-splicing είναι ένας διαμοριακός μηχανισμός που αφαιρεί εσώνια ή άουτρονια και ενώνει τα εξόνια που δεν βρίσκονται στο ίδιο μεταγράφημα RNA. Έτσι, αυτό ολοκληρώνει τη συζήτηση για τη διαφορά μεταξύ cis και trans splicing.
