Η βασική διαφορά μεταξύ VNTR και ανιχνευτή είναι ότι το VNTR είναι μια σύντομη αλληλουχία νουκλεοτιδίων που εμφανίζεται ως διαδοχική επανάληψη στο γονιδίωμα, ενώ ένας ανιχνευτής είναι μια τεχνητά συντιθέμενη σύντομη αλληλουχία DNA ή RNA που θα μπορούσε να επισημανθεί ραδιενεργά.
Το VNTR σημαίνει διαδοχική επανάληψη μεταβλητών αριθμών. Είναι μια σύντομη αλληλουχία νουκλεοτιδίων οργανωμένη σε διαδοχικές επαναλήψεις στο γονιδίωμα. Τα VNTR απαντώνται φυσικά στο γονιδίωμά μας. Ένας ανιχνευτής είναι μια τεχνητά συντιθέμενη σύντομη αλληλουχία DNA ή RNA. Τόσο ο ανιχνευτής όσο και το VNTR είναι νουκλεϊκά οξέα ή σύντομες αλληλουχίες νουκλεοτιδίων. Έχουν τεράστια χρήση σε διάφορες μοριακές βιολογικές τεχνικές, κυρίως σε εγκληματολογικές μελέτες. Το VNTR και το probe μοιράζονται κάποιες ομοιότητες αλλά και διαφορές. Ως εκ τούτου, το άρθρο επιχειρεί να επισημάνει τη διαφορά μεταξύ VNTR και probe.
Τι είναι το VNTR;
Το VNTR είναι μια σύντομη αλληλουχία νουκλεοτιδίων που υπάρχει ως διαδοχική επανάληψη στο γονιδίωμά μας. Τα VNTRs υπάρχουν σε πολλά χρωμοσώματα. Επιπλέον, τα VNTR διαφέρουν μεταξύ διαφορετικών ατόμων από το μήκος, καθώς ο αριθμός των επαναλήψεων είναι διαφορετικός στα VNTR διαφορετικών ατόμων. Βασικά, οφείλεται σε αλληλόμορφα που κληρονόμησαν από τους γονείς τους. Επομένως, χρησιμοποιούμε κυρίως VNTR για γονικές ταυτότητες (κληρονομικότητα) ή για προσωπικούς σκοπούς. Ομοίως, είναι επίσης δυνατή η χρήση τους στη γενετική, την εγκληματολογία, τη βιολογική έρευνα και τη λήψη δακτυλικών αποτυπωμάτων DNA. Επομένως, το VNTR είναι ένα σημαντικό εργαλείο στη μοριακή βιολογία.
Εικόνα 01: VNTR
Στην κληρονομικότητα, αναλύουμε τα δεδομένα VNTR χρησιμοποιώντας δύο βασικές αρχές: αντιστοίχιση κληρονομικότητας και αντιστοίχιση ταυτότητας. Κατά τη διάρκεια της αντιστοίχισης κληρονομικότητας, το άτομο πρέπει να έχει ένα αλληλόμορφο που ταιριάζει με αυτό κάθε γονέα. Κατά την αντιστοίχιση ταυτότητας, και τα δύο αλληλόμορφα VNTR πρέπει να υπάρχουν σε μια συγκεκριμένη θέση του γονιδιώματος.
Τι είναι ένας ανιχνευτής;
Στο πλαίσιο της μοριακής βιολογίας, ένας ανιχνευτής είναι ένα τεχνητά συντιθέμενο θραύσμα DNA ή RNA με μήκος 100 έως 1000 βάσεων. Μπορούμε να επισημάνουμε ραδιενεργά αυτούς τους ανιχνευτές. Ως εκ τούτου, τα χρησιμοποιούμε για την ανίχνευση αλληλουχιών νουκλεοτιδίων-στόχων που είναι συμπληρωματικές με την αλληλουχία του ανιχνευτή. Όταν προσθέτουμε ανιχνευτές στο δείγμα, πραγματοποιείται υβριδισμός με τις συμπληρωματικές αλληλουχίες ή τις αλληλουχίες-στόχους και μας διευκολύνει να αναγνωρίσουμε τις αλληλουχίες-στόχους. Δεδομένου ότι οι ανιχνευτές μεταφέρουν ραδιενέργεια, μπορούμε να τους εντοπίσουμε εύκολα.
Εικόνα 02: Ανιχνευτής
Στην εγκληματολογική επιστήμη, χρησιμοποιούμε συνήθως ανιχνευτές σε τεχνικές διαμόρφωσης προφίλ DNA, όπως η ανίχνευση περιοχών σύντομης διαδοχικής επανάληψης, πολυμορφισμών μήκους περιοριστικού θραύσματος και δακτυλικών αποτυπωμάτων DNA.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ VNTR και Probe;
- Τα νουκλεϊκά οξέα είναι τα δομικά στοιχεία του VNTR και του Probe.
- Τα χρησιμοποιούμε σε διαδικασίες γονιδιακής ταυτοποίησης.
- Επίσης, και τα δύο μήκη τους είναι μεταβλητά.
- Είναι σημαντικά εργαλεία σε εγκληματολογικές μελέτες, δακτυλικά αποτυπώματα DNA, γενετική κ.λπ.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ VNTR και Probe;
Το VNTR είναι μια περιοχή του γονιδιώματος οργανωμένη ως διαδοχικές επαναλήψεις, ενώ ένας ανιχνευτής είναι μια σύντομη αλληλουχία DNA ή RNA που συντίθεται τεχνητά για να ανιχνεύσει αλληλουχίες-στόχους σε ένα δείγμα. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ VNTR και probe. Επίσης, μια σημαντική διαφορά μεταξύ του VNTR και του ανιχνευτή είναι ότι σε αντίθεση με τα VNTR, μπορούμε να επισημάνουμε ραδιενεργά τους ανιχνευτές.
Επιπλέον, τα VNTR εκτελούν ως επί το πλείστον γονικές ταυτοποιήσεις, ενώ οι ανιχνευτές βοηθούν στην ανίχνευση αλληλουχιών νουκλεοτιδίων-στόχων σε δείγματα DNA ή RNA που είναι συμπληρωματικά με την αλληλουχία του ανιχνευτή. Ως εκ τούτου, αυτή είναι επίσης μια σημαντική διαφορά μεταξύ VNTR και ανιχνευτή.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει περισσότερες πληροφορίες σχετικά με τη διαφορά μεταξύ VNTR και probe.
Σύνοψη – VNTR vs Probe
Η κοινή χρήση του VNTR και του ανιχνευτή είναι σε τεχνικές μοριακής ανάλυσης, όπως εγκληματολογικές μελέτες και δακτυλικά αποτυπώματα DNA. Και τα δύο αποτελούνται από μεταβλητά μήκη. Ωστόσο, η βασική διαφορά μεταξύ VNTR και ανιχνευτή είναι ότι ένα VNTR είναι μια περιοχή του γονιδιώματος διατεταγμένη με διαδοχικές επαναλήψεις, ενώ ένας ανιχνευτής είναι ένα θραύσμα DNA ή RNA που θα μπορούσε να επισημανθεί ραδιενεργά. Επιπλέον, οι VNTRs υπάρχουν στο γονιδίωμα. Όμως, οι ανιχνευτές συντίθενται τεχνητά και θα μπορούσαν να επισημανθούν ραδιενεργά για να ανιχνεύσουν στοχευόμενες αλληλουχίες νουκλεοτιδίων σε δείγματα DNA ή RNA που είναι συμπληρωματικά με την αλληλουχία στον ανιχνευτή. Έτσι, αυτή είναι η περίληψη της διαφοράς μεταξύ VNTR και ανιχνευτή.
