Βασική διαφορά – VNTR εναντίον STR
Οι μελέτες DNA έχουν τεράστια χρησιμότητα για την κατανόηση και τον προσδιορισμό των φυλογενετικών σχέσεων, τη διάγνωση γενετικών ασθενειών και τη χαρτογράφηση των γονιδιωμάτων του οργανισμού. Διάφορες τεχνικές που σχετίζονται με την ανάλυση DNA χρησιμοποιούνται για την ταυτοποίηση ενός συγκεκριμένου γονιδίου ή μιας αλληλουχίας DNA σε μια δεξαμενή άγνωστου DNA. Είναι γνωστοί ως γενετικοί δείκτες. Οι γενετικοί δείκτες χρησιμοποιούνται στη μοριακή βιολογία για τον εντοπισμό γενετικών διαφορών μεταξύ ατόμων και ειδών. Η διαδοχική επανάληψη μεταβλητού αριθμού (VNTR) και η σύντομη διαδοχική επανάληψη (STR) είναι δύο τύποι γενετικών δεικτών που δείχνουν πολυμορφισμό μεταξύ των ατόμων. Και οι δύο τύποι είναι μη κωδικοποιητικό επαναλαμβανόμενο DNA που είναι διαδοχικές επαναλήψεις. Είναι διατεταγμένα στα χρωμοσώματα με έναν τρόπο από το κεφάλι προς την ουρά. Το VNTR είναι ένα τμήμα του γονιδιώματος όπου η σύντομη αλληλουχία νουκλεοτιδίων επαναλαμβάνεται αρκετές φορές. Το STR είναι ένα άλλο τμήμα DNA μέσα στο γονιδίωμα το οποίο οργανώνεται ως επαναλαμβανόμενες μονάδες που αποτελούνται από δύο έως δεκατρία νουκλεοτίδια σε εκατό φορές. Η βασική διαφορά μεταξύ VNTR και STR είναι ο αριθμός των νουκλεοτιδίων σε μια επαναλαμβανόμενη αλληλουχία. Οι επαναλαμβανόμενες μονάδες του VNTR αποτελούνται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια ενώ η επαναλαμβανόμενη μονάδα του STR αποτελείται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια. Το VNTR και το STR χρησιμοποιούνται ευρέως σε εγκληματολογικές μελέτες.
Τι είναι το VNTR;
Μια διαδοχική επανάληψη είναι μια σύντομη αλληλουχία DNA που επαναλαμβάνεται κατά τρόπο κεφαλή σε ουρά σε έναν συγκεκριμένο χρωμοσωμικό τόπο. Δεν υπάρχει άλλη αλληλουχία ή νουκλεοτίδιο στη διαδοχική επανάληψη. Υπάρχουν διάφοροι τύποι διαδοχικών επαναλήψεων στο γονιδίωμα. Το VNTR είναι ένας τύπος διαδοχικής επανάληψης μεταξύ τους που έχει επαναλαμβανόμενες μονάδες που αποτελούνται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια. Το VNTR είναι ένας τύπος μίνι δορυφόρου. Αυτές οι διαδοχικές επαναλήψεις μπορούν να βρεθούν σε πολλά χρωμοσώματα. Είναι διάσπαρτα στο ανθρώπινο γονιδίωμα και βρίσκονται κυρίως στις υποτελομερείς περιοχές των χρωμοσωμάτων.
Τα VNTR εμφανίζουν διαδοχική επανάληψη πολυμορφισμού μεταξύ των ατόμων. Το μήκος του VNTR σε μια συγκεκριμένη θέση του χρωμοσώματος είναι πολύ μεταβλητό μεταξύ των ατόμων λόγω της διακύμανσης στον αριθμό των επαναλαμβανόμενων μονάδων που οργανώνονται σε αυτό το τμήμα DNA. Ως εκ τούτου, το VNTR μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως ένα ισχυρό εργαλείο για την αναγνώριση ατόμων και η ανάλυση VNTR χρησιμοποιείται σε πολλούς τομείς, όπως η γενετική, η έρευνα στη βιολογία, η εγκληματολογία και η δακτυλική εκτύπωση DNA. Οι VNTRs ήταν οι πρώτοι γενετικοί δείκτες που χρησιμοποιήθηκαν για την ποσοτικοποίηση της μεταμόσχευσης μυελού των οστών. Οι VNTRs ήταν επίσης οι πρώτοι πολυμορφικοί δείκτες που χρησιμοποιήθηκαν στο προφίλ DNA στην εγκληματολογία.
Εικόνα 01: Παραλλαγή των VNTR σε έξι άτομα
Η ανάλυση VNTR πραγματοποιείται μέσω πολυμορφισμού μήκους θραύσματος περιορισμού που ακολουθείται από υβριδισμό νότιας. Ως εκ τούτου, χρειάζεται συγκριτικά ένα μεγάλο δείγμα DNA. Η ερμηνεία του προφίλ VNTR είναι επίσης προβληματική. Λόγω αυτών των περιορισμών, η χρήση του VNTR στην εγκληματολογική γενετική έχει περιοριστεί και έχει αντικατασταθεί από ανάλυση STR.
Τι είναι το STR;
Το STR είναι ένα άκρως επαναλαμβανόμενο τμήμα DNA που αποτελείται από δύο έως δεκατρείς επαναλαμβανόμενες μονάδες νουκλεοτιδίων οργανωμένων κατά διαδοχικό τρόπο. Το STR είναι παρόμοιο με το VNTR. Αλλά ποικίλλει από το VNTR από τον αριθμό των νουκλεοτιδίων σε μια επαναλαμβανόμενη αλληλουχία και τον αριθμό των επαναλήψεων. Το STR είναι ένας τύπος μικροδορυφόρου.
Η ανάλυση STR εμπλέκεται στη μέτρηση του ακριβούς αριθμού των επαναλαμβανόμενων μονάδων. Τα STR είναι πολύ μεταβλητά μεταξύ των ατόμων, παρόμοια με τα VNT. Τα προφίλ STR διαφέρουν από άτομο σε άτομο. Ως εκ τούτου, η ανάλυση STR χρησιμοποιείται στη μοριακή βιολογία για τη σύγκριση ειδικών τόπων στο DNA από δύο ή περισσότερα δείγματα. Ως εκ τούτου, οι STRs θεωρούνται ως ισχυροί γενετικοί δείκτες στη μοριακή βιολογία. Παρέχει ένα εξαιρετικό εργαλείο για την αναγνώριση ατόμων λόγω του υψηλού βαθμού πολυμορφισμού τους και του σχετικά μικρού μήκους.
Προς το παρόν, τα STR είναι το πιο συχνά χρησιμοποιούμενο αναλυόμενο εργαλείο γενετικού πολυμορφισμού στην εγκληματολογική γενετική. Οι περισσότερες ιατροδικαστικές υποθέσεις περιλαμβάνουν πολυμορφική ανάλυση STR. Οι τόποι STR εξαπλώνονται σε όλο το γονιδίωμα. Υπάρχουν χιλιάδες STR που βρίσκονται σε χρωμοσώματα που μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην εγκληματολογική ανάλυση. Η ανάλυση STR δεν περιλαμβάνει πολυμορφισμό περιοριστικού μήκους όπως η ανάλυση VNTR. Η ανάλυση STR δεν κόβει το DNA με ένζυμα περιορισμού. Χρησιμοποιούνται ειδικοί ανιχνευτές για την προσάρτηση των επιθυμητών περιοχών στο DNA και χρησιμοποιώντας την τεχνική PCR, προσδιορίζονται τα μήκη του STR.
Εικόνα 02: Διακύμανση STR μεταξύ δειγμάτων
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ VNTR και STR;
- VNTR και STR είναι μη κωδικοποιητικό DNA.
- Και οι δύο είναι διαδοχικές επαναλήψεις.
- Και τα δύο παρουσιάζουν πολυμορφισμό μεταξύ των ατόμων λόγω της διαφοράς στο μήκος του τμήματος DNA.
- Και οι δύο χρησιμοποιούνται ως ισχυροί γενετικοί δείκτες στη δακτυλική αποτύπωση DNA και σε ιατροδικαστικές μελέτες.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ VNTR και STR;
VNTR εναντίον STR |
|
| Το VNTR είναι ένα μη κωδικοποιητικό επαναλαμβανόμενο DNA που έχει μια σύντομη αλληλουχία νουκλεοτιδίων που επαναλαμβάνεται κατά σειρά. | Το STR είναι ένα άκρως επαναλαμβανόμενο τμήμα DNA που αποτελείται από δύο έως δεκατρείς επαναλαμβανόμενες μονάδες νουκλεοτιδίων οργανωμένων κατά σειρά. |
| Μέγεθος | |
| Τα VNTR είναι μεγαλύτερα από τα STR. | Τα STR είναι μικρότερα από τα VNTR. |
| Αριθμός νουκλεοτιδίων σε επαναλαμβανόμενη ακολουθία | |
| Η επαναλαμβανόμενη μονάδα του VNTR αποτελείται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια. | Η επαναλαμβανόμενη μονάδα του STR αποτελείται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια. |
Σύνοψη – VNTR vs STR
Το VNTR και STR είναι δύο ισχυροί γενετικοί δείκτες που χρησιμοποιούνται στη μοριακή βιολογία, ειδικά στον τομέα της εγκληματολογικής γενετικής. Το VNTR είναι ένας τύπος μίνι δορυφόρου και ο STR είναι ένας μικροδορυφόρος. Το VNTR και το STR είναι μη κωδικοποιητικό, εξαιρετικά επαναλαμβανόμενο DNA. Είναι διαδοχικές επαναλήψεις. Η γενική δομή του VNTR και του STR είναι η ίδια. Ωστόσο, ο αριθμός των νουκλεοτιδίων στην επαναλαμβανόμενη αλληλουχία και το μήκος είναι διαφορετικά. Το VNTR έχει επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες που αποτελούνται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια. Το STR έχει επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες που αποτελούνται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια. Αυτή είναι η διαφορά μεταξύ VNTR και STR.
Λήψη έκδοσης PDF του VNTR εναντίον STR
Μπορείτε να κατεβάσετε την έκδοση PDF αυτού του άρθρου και να τη χρησιμοποιήσετε για σκοπούς εκτός σύνδεσης σύμφωνα με τις σημειώσεις παραπομπών. Κάντε λήψη της έκδοσης PDF εδώ Διαφορά μεταξύ VNTR και STR.
