siRNA εναντίον miRNA
Τα RNA είναι πολύ σημαντικά μόρια, τα οποία βοηθούν στη δημιουργία της ζωής των οργανισμών. Πρόσφατα οι επιστήμονες ανακάλυψαν μικρά RNA που ονομάζονται παρεμβολή RNA ή RNAi, τα οποία δρουν μετά τη μεταγραφή για τον έλεγχο της γονιδιακής έκφρασης. Οι δύο κύριοι τύποι μικρών RNA είναι το micro RNA ή miRNA και το μικρό παρεμβαλλόμενο RNA ή siRNA. Αυτά τα μόρια βασικά ρυθμίζουν τη γονιδιακή έκφραση καταστέλλοντας το γονίδιο στόχο. Τόσο το miRNA όσο και το siRNA έχουν πολύ παρόμοια μονοπάτια βιογένεσης, αν και υπάρχουν κάποιες διαφορές μεταξύ τους. Η προέλευση του miRNA και του siRNA είναι από μόρια dsRNA. Τα ώριμα miRNA είναι δομικά παρόμοια με τα μόρια siRNA.
miRNA
Micro RNA ή miRNAs είναι τα μικρά μόρια RNA που μεσολαβούν στον τελικό έλεγχο στη ρύθμιση του μεταφραστικού γονιδίου. Η απορρύθμιση του miRNA μπορεί να οδηγήσει σε ανάπτυξη καρκίνου και άλλων ασθενειών. Επομένως, η σωστή ρύθμιση των πληροφοριών που κωδικοποιούνται στη μη κωδικοποιητική περιοχή του miRNA είναι πολύ κρίσιμη σε πολλές θεμελιώδεις κυτταρικές διεργασίες.
siRNA
Τα siRNA αναφέρονται επίσης ως βραχύ παρεμβολή ή σίγαση RNA και αποτελούνται από δίκλωνο RNA με 20 έως 25 ζεύγη βάσεων. Ο κύριος ρόλος του siRNA είναι να παρεμβαίνει στην έκφραση συγκεκριμένων γονιδίων με συμπληρωματικές νουκλεοτιδικές αλληλουχίες. Το siRNA αποτελείται από βραχύ δίκλωνο RNA με φωσφορυλιωμένα άκρα 5' και υδροξυλιωμένα άκρα 3' με δύο προεξέχοντα νουκλεοτίδια.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ siRNA και miRNA;
• το miRNA προέρχεται από συγκεκριμένους γονιδιωματικούς τόπους, ενώ το siRNA προέρχεται από mRNA, τρανσποζόνια, ιούς ή ετεροχρωματικό DNA.
• Η σύνθεση του miRNA υποβάλλεται σε επεξεργασία από μεταγραφές μακρύτερων πρόδρομων φουρκέτας (πρωτογενής πυρηνική αλληλουχία miRNA από ενδονουκλεάση RNase III), ενώ αυτή του siRNA που επεξεργάζεται από μακρά διμοριακά διπλά RNA.
• Κάθε μόριο πρόδρομης φουρκέτας miRNA παράγει ένα διπλό miRNA, ενώ κάθε πρόδρομο μόριο siRNA παράγει πολλαπλά διπλά siRNA.
• οι αλληλουχίες siRNA σπάνια διατηρούνται, ενώ οι αλληλουχίες miRNA είναι καλά διατηρημένες.
• Όλες οι βάσεις εντός του siRNA συμβάλλουν στην εξειδίκευση του στόχου, ενώ μόνο το 5' του miRNA συμβάλλει στην εξειδίκευση του στόχου του.
• το miRNA συχνά συνδέεται με την 3' αμετάφραστη περιοχή των μεταγραφών στόχων, ενώ τα siRNA σχηματίζουν συμπληρωματικό διπλό οπουδήποτε κατά μήκος ενός mRNA στόχου.
• το miRNA προσδιορίζει την «ετεροσίγαση» ενώ το siRNA χρησιμοποιείται για την «αυτόματη σίγαση».
• το miRNA δρα ως σήμα για την πρόληψη της μετάφρασης, ενώ το siRNA εμποδίζει φυσικά τη μετάφραση.
