Η βασική διαφορά μεταξύ ολιγοπεπτιδίου και πολυπεπτιδίου είναι ότι τα ολιγοπεπτίδια περιέχουν λίγα υπολείμματα αμινοξέων, ενώ τα πολυπεπτίδια περιέχουν μεγάλο αριθμό υπολειμμάτων αμινοξέων.
Οι όροι ολιγοπεπτίδια και πολυπεπτίδια ανήκουν στην κατηγορία των πρωτεϊνών. Τα πεπτίδια είναι μικρές αλυσίδες αμινοξέων. Τα αμινοξέα συνδέονται μεταξύ τους μέσω πεπτιδικών δεσμών. Επομένως, μπορούμε να κατηγοριοποιήσουμε αυτά τα πεπτίδια σύμφωνα με τον αριθμό των αμινοξέων που υπάρχουν σε αυτά τα πεπτίδια. Π.χ., διπεπτίδια, τριπεπτίδια, τετραπεπτίδια, ολιγοπεπτίδια και πολυπεπτίδια.
Τι είναι ολιγοπεπτίδιο;
Ένα ολιγοπεπτίδιο είναι μια αλυσίδα αμινοξέων που περιέχει μικρό αριθμό αμινοξέων ανά μόριο. Συχνά ονομάζουμε αυτά τα μόρια «πεπτίδια», ως γενικό όρο. Ο αριθμός των υπολειμμάτων αμινοξέων που υπάρχουν σε αυτά τα πεπτιδικά μόρια μπορεί να κυμαίνεται από δύο έως είκοσι αμινοξέα. Τα ολιγοπεπτίδια μπορούν επίσης να περιλαμβάνουν ορισμένες μικρές πεπτιδικές μορφές όπως διπεπτίδια, τριπεπτίδια, κ.λπ. Μερικά κοινά παραδείγματα φυσικών ολιγοπεπτιδίων περιλαμβάνουν μικροβιριδίνη, κυανοπεπτολίνες, μικροκυστίνες, κ.λπ.
Εικόνα 01: Δομή ενός Τριπεπτιδίου
Αυτά τα ολιγοπεπτίδια παράγονται από συνθάσες μη ριβοσωμικών πεπτιδίων ή NRPS. Υπάρχουν όμως κάποιες εξαιρέσεις. Για παράδειγμα, τα κυκλαμίδια και η μικροβιριδίνη συντίθενται μέσω ριβοσωμικών οδών. Η διαδικασία απομόνωσης ολιγοπεπτιδίων περιλαμβάνει ολιγοπεπτιδικό εμπλουτισμό, καθαρισμό και ταυτοποίηση. Για τη διαδικασία ταυτοποίησης, μπορούμε να χρησιμοποιήσουμε χρωματογραφία γέλης, HPLC, φασματοσκοπία μάζας HPLC, χρωματογραφία ανταλλαγής ιόντων κ.λπ.
Τι είναι το Πολυπεπτίδιο
Ένα πολυπεπτίδιο είναι μια αλυσίδα υπολειμμάτων αμινοξέων που περιέχουν μεγάλο αριθμό αμινοξέων. Μια πρωτεΐνη περιέχει μία ή περισσότερες πολυπεπτιδικές αλυσίδες. Σε αυτές τις πολυπεπτιδικές αλυσίδες, τα αμινοξέα συνδέονται μεταξύ τους μέσω πεπτιδικών δεσμών, οι οποίοι είναι ένας τύπος ομοιοπολικών χημικών δεσμών. Κάθε πολυπεπτιδική αλυσίδα περιέχει δύο τερματικά: Ν-τελικό και Ο-τελικό. Το Ν-τελικό είναι το αμινοτελικό, το οποίο τελειώνει με μια ελεύθερη αμινομάδα, ενώ το Ο-τερματικό είναι το καρβοξυτελικό άκρο που τελειώνει με μια ελεύθερη καρβοξυλική ομάδα. Η αλληλουχία των αμινοξέων που υπάρχουν σε ένα πεπτίδιο προσδιορίζεται από τα κωδικόνια στο mRNA που εμπλέκονται στην παραγωγή του πολυπεπτιδίου ή της πρωτεΐνης μέσω της μετάφρασης του κλώνου του εκμαγείου.
Σύμφωνα με τον αριθμό και τη διάταξη των πολυπεπτιδίων σε μια πρωτεΐνη, υπάρχουν τέσσερις κύριοι τύποι πρωτεϊνικών δομών ως εξής:
- Πρωτογενής δομή – Η πρωτογενής δομή μιας πρωτεΐνης περιέχει μια μοναδική πολυπεπτιδική αλυσίδα που έχει δισουλφιδικές γέφυρες μεταξύ ορισμένων αμινοξέων στην ίδια αλυσίδα, η οποία δημιουργεί μια διπλωμένη δομή.
- Δευτερογενής δομή – Η δευτερογενής δομή μιας πρωτεΐνης έχει δύο κύριες μορφές: δομή άλφα-έλικας και δομή βήτα φύλλου.
Εικόνα 02: Δομή Alpha Helix
- Τριτογενής δομή – Αυτή είναι μια πολύ αναδιπλωμένη δομή δικτύου. Αυτή η δομή είναι πολύ σημαντική γιατί καθορίζει τη λειτουργία μιας πρωτεΐνης.
- Τεταρτοταγής δομή – Πρόκειται για μια εξαιρετικά πολύπλοκη δομή δύο ή τριών πολυπεπτιδικών αλυσίδων που συνδέονται μεταξύ τους.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ ολιγοπεπτιδίου και πολυπεπτιδίου;
Ολιγοπεπτίδια και πολυπεπτίδια είναι δύο διαφορετικές κατηγορίες πρωτεϊνών. Διαφέρουν μεταξύ τους ανάλογα με τον αριθμό των υπολειμμάτων αμινοξέων που υπάρχουν στα μόρια της πρωτεΐνης. Επομένως, η βασική διαφορά μεταξύ ολιγοπεπτιδίου και πολυπεπτιδίου είναι ότι τα ολιγοπεπτίδια περιέχουν λίγα υπολείμματα αμινοξέων, ενώ τα πολυπεπτίδια περιέχουν μεγάλο αριθμό υπολειμμάτων αμινοξέων.
Το παρακάτω infographic συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ ολιγοπεπτιδίου και πολυπεπτιδίου.
Σύνοψη – Ολιγοπεπτίδιο έναντι πολυπεπτιδίου
Ολιγοπεπτίδια και πολυπεπτίδια είναι δύο διαφορετικές κατηγορίες πρωτεϊνών. Διαφέρουν μεταξύ τους, ανάλογα με τον αριθμό των υπολειμμάτων αμινοξέων που υπάρχουν σε αυτά τα πρωτεϊνικά μόρια. Δηλαδή, η βασική διαφορά μεταξύ ολιγοπεπτιδίου και πολυπεπτιδίου είναι ότι τα ολιγοπεπτίδια περιέχουν λίγα υπολείμματα αμινοξέων, ενώ τα πολυπεπτίδια περιέχουν μεγάλο αριθμό υπολειμμάτων αμινοξέων.
