Η βασική διαφορά μεταξύ synteny και collinearity είναι ότι synteny είναι ο φυσικός συνεντοπισμός γενετικών τόπων στο ίδιο χρωμόσωμα στα είδη, ενώ η συγγραμμικότητα είναι ο φυσικός συνεντοπισμός γενετικών τόπων στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη διατήρησης την ίδια σειρά.
Συντενία και συγγραμμικότητα είναι δύο όροι που χρησιμοποιούνται εναλλακτικά στη γονιδιωματική. Και οι δύο όροι περιγράφουν τα μοτίβα εντοπισμού γονιδίων στα χρωμοσώματα σε διαφορετικά είδη. Αυτές οι σχετικές γονιδιακές διευθετήσεις μεταξύ των ταξινομικών κατηγοριών είναι πολύτιμες πληροφορίες όταν συνάγεται η κοινή καταγωγή των γονιδίων. Το Synteny αναφέρεται στον φυσικό συνεντοπισμό γενετικών τόπων στο ίδιο χρωμόσωμα στα είδη. Η συγγραμμικότητα αναφέρεται στον φυσικό συνεντοπισμό γενετικών τόπων στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη που διατηρούν την ίδια σειρά. Επομένως, είναι μια μορφή synteny.
Τι είναι το Synteny;
Σε διαφορετικά είδη, υπάρχει ένα σύνολο γονιδίων που βρίσκονται στο ίδιο χρωμόσωμα. Και, αυτός ο φυσικός συνεντοπισμός γονιδίων στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη είναι γνωστός ως synteny. Επίσης, αυτά τα γονίδια βρίσκονται πολύ κοντά το ένα στο άλλο σε ένα μόνο χρωμόσωμα. Η σειρά των γονιδίων μπορεί να μην είναι απαραίτητα η ίδια. Όμως, η εντόπιση των γονιδίων το ένα κοντά στο άλλο στο ίδιο χρωμόσωμα λαμβάνει χώρα σε synteny. Επομένως, το synteny περιγράφει κυρίως το πρότυπο κατανομής των γονιδίων σε ένα χρωμόσωμα. Αυτά τα μοτίβα συνεντοπισμού γονιδίων υποδεικνύουν σχέσεις μεταξύ διαφορετικών ειδών και την εξέλιξή τους. Ωστόσο, το synteny μπορεί να διαταραχθεί λόγω χρωμοσωμικών αναδιατάξεων όπως μετατοπίσεις, αναστροφή και σύντηξη χρωμοσωμάτων κ.λπ. διπλασιασμοί, απώλεια και άνισος ομόλογος ανασυνδυασμός.
Εικόνα 01: Synteny
Πιστεύεται ότι όλα τα συνδεδεμένα γονίδια είναι συνθετικά. Ωστόσο, δεν συνδέονται απαραίτητα όλα τα συνθετικά γονίδια. Έχουν κοινές αλληλουχίες χρωμοσωμάτων. Οι άνθρωποι έχουν πολλά συνθετικά γονίδια με άλλα θηλαστικά. Επιπλέον, πολλά δημητριακά έχουν συνθετικά γονίδια.
Τι είναι η συγγραμμικότητα;
Η συγγραμμικότητα είναι μια πιο συγκεκριμένη μορφή synteny στην οποία ένα σύνολο γονιδίων βρίσκεται στο ίδιο χρωμόσωμα διαφορετικών ειδών με την ίδια σειρά όπως και στα προγονικά είδη. Επομένως, εάν υπάρχει απόκλιση από τη συγγραμμικότητα, θα είναι πιο αξιόπιστος φυλογενετικός χαρακτήρας αφού η συγγραμμικότητα εξηγεί την κοινή καταγωγή των γονιδίων.
Εικόνα 02: Συγγραμμικότητα
Η ανάλυση συγγραμμικότητας πολλαπλών οδών παρέχει πολύ πιο αξιόπιστες πληροφορίες σχετικά με τα σχετικά είδη και τη φυλογένειά τους.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ Synteny και Συγγραμμικότητας;
- Σε συνθετικότητα και συγγραμμικότητα, ένα σύνολο τόπων σε δύο διαφορετικά είδη βρίσκεται στο ίδιο χρωμόσωμα.
- Αυτοί οι όροι περιγράφουν τον φυσικό συνεντοπισμό γενετικών τόπων στο ίδιο χρωμόσωμα.
- Η συγγραμμικότητα είναι μια πιο συγκεκριμένη μορφή synteny.
- Μερικές φορές και οι δύο όροι χρησιμοποιούνται εναλλακτικά στη γονιδιωματική.
- Αν δύο περιοχές έχουν συγγραμμικότητα, είναι προφανώς συνθετικές.
- Είναι χρήσιμα στο συμπέρασμα της φυλογένεσης.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Synteny και Συγγραμμικότητας;
Συντενία και συγγραμμικότητα είναι δύο όροι που χρησιμοποιούνται εναλλακτικά στη γονιδιωματική. Το Synteny αναφέρεται στον φυσικό συνεντοπισμό ενός συνόλου γονιδίων στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη. Η συγγραμμικότητα είναι μια μορφή synteny στην οποία το σύνολο των γονιδίων συνεντοπίζεται με την ίδια σειρά μεταξύ των διαφορετικών ειδών. Επομένως, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ synteny και collinearity.
Σύνοψη – Synteny vs Colinearity
Οι όροι synteny και collinearity αναφέρονται σε ένα σύνολο γονιδίων που βρίσκονται στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη. Στην πραγματικότητα, αυτά τα γονίδια συνεντοπίζονται στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη. Το Synteny περιγράφει τον φυσικό συνεντοπισμό γονιδίων συνόλου στο ίδιο χρωμόσωμα σε διαφορετικά είδη, ενώ η συγγραμμικότητα είναι μια πιο συγκεκριμένη μορφή synteny στην οποία το σύνολο των γονιδίων συνεντοπίζεται με την ίδια σειρά. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ synteny και collinearity.
