Η βασική διαφορά μεταξύ TATA και CAAT box είναι ότι το κουτί TATA είναι μια διατηρημένη νουκλεοτιδική περιοχή που έχει μια συναινετική αλληλουχία TATAWAW ενώ το πλαίσιο CAAT είναι μια διατηρημένη περιοχή νουκλεοτιδίων με μια συναινετική αλληλουχία GGCCAATCT.
Το Το κουτί TATA και το πλαίσιο CAAT είναι δύο περιοχές νουκλεοτιδίων που επηρεάζουν τη μεταγραφή των ευκαρυωτικών γονιδίων. Είναι μη κωδικοποιητικές αλληλουχίες DNA που βρίσκονται ανάντη στη θέση έναρξης της μεταγραφής. Στην πραγματικότητα, βρίσκονται στη ρυθμιστική περιοχή, η οποία είναι γνωστή ως προαγωγέας. Τόσο το κουτί TATA όσο και το κουτί CAAT είναι υπεύθυνα για την αποτελεσματικότητα της μεταγραφής. Είναι συναινετικές αλληλουχίες που δεν έχουν αλλάξει σε όλη την εξελικτική διαδικασία.
Τι είναι το TATA Box;
Το Το κουτί TATA ή το κουτί Goldberg-Hogness είναι μια συναινετική αλληλουχία που βρίσκεται στην περιοχή προαγωγέα των ευκαρυωτικών γονιδίων. Το κουτί TATA είναι ένα βασικό στοιχείο του προαγωγέα. Βρίσκεται 25 ζεύγη βάσεων ανάντη της θέσης έναρξης της μεταγραφής. Διατηρείται σε όλη την εξελικτική διαδικασία. Η συναινετική αλληλουχία του πλαισίου TATA είναι η TATAWAW, όπου το W είναι είτε Α είτε Τ. Είναι μια μη κωδικοποιητική αλληλουχία DNA. Ωστόσο, το κουτί TATA είναι σημαντικό για τη μεταγραφή του γονιδίου. Είναι η θέση δέσμευσης της πρωτεΐνης δέσμευσης TATA (TBP) και άλλων μεταγραφικών παραγόντων. Μόλις δεσμευτούν στο κουτί TATA, η στρατολόγηση της RNA πολυμεράσης II και η σωστή ρύθμιση της μεταγραφής λαμβάνει χώρα στα ευκαρυωτικά γονίδια.
Εικόνα 01: TATA Box
Δεδομένου ότι το κουτί TATA εμπλέκεται στη ρύθμιση της μεταγραφής, οι μεταλλάξεις του κουτιού TATA μπορούν να οδηγήσουν σε φαινοτυπικές αλλαγές που οδηγούν σε ασθένειες όπως ο καρκίνος του στομάχου, η νωτιαία παρεγκεφαλιδική αταξία, η νόσος του Huntington, η τύφλωση, η β-θαλασσαιμία, η ανοσοκαταστολή, το σύνδρομο Gilbert, και HIV-1, κ.λπ.
Τι είναι το CAAT Box;
Το κουτί CAAT είναι μια περιοχή νουκλεοτιδίων με τη συναινετική αλληλουχία του GGCCAATCT. Παρόμοια με το κουτί TATA, το κουτί CAAT βρίσκεται επίσης στην περιοχή προαγωγέα του γονιδίου. Επομένως, βρίσκεται περίπου 75-80 ζεύγη βάσεων ανάντη προς τη θέση μεταγραφής.
Εικόνα 02: CAAT Box
Συγκεκριμένοι μεταγραφικοί παράγοντες συνδέονται με το πλαίσιο CAAT. Αυτή η σύνδεση σταθεροποιεί το σύμπλεγμα προεκκίνησης για ευκολότερη σύνδεση του ενζύμου RNA πολυμεράση. Ομοίως, το πλαίσιο CAAT λειτουργεί ως ρυθμιστική ακολουθία. Οι μεταλλάξεις στην περιοχή του κουτιού CAAT επηρεάζουν σε μεγάλο βαθμό την απόκριση του προαγωγέα και τη ρύθμιση της μεταγραφής.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ TATA και CAAT Box;
- TATA και CAAT είναι δύο περιοχές νουκλεοτιδίων που βρίσκονται στη ρυθμιστική αλληλουχία των ευκαρυωτικών γονιδίων.
- Βρίσκονται ανάντη προς την τοποθεσία έναρξης μεταγραφής.
- Και οι δύο είναι συναινετικές αλληλουχίες DNA.
- Είναι απαραίτητα για τη ρύθμιση της μεταγραφής, επομένως είναι ρυθμιστικές αλληλουχίες.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ TATA και CAAT Box;
Το κουτί TATA είναι μια διατηρημένη περιοχή νουκλεοτιδίων που βρίσκεται περίπου 25-30 ζεύγη βάσεων ανάντη προς τη θέση έναρξης της μεταγραφής. Από την άλλη πλευρά, το κουτί CAAT είναι μια διατηρημένη περιοχή νουκλεοτιδίων που βρίσκονται περίπου 75-80 ζεύγη βάσεων ανάντη προς τη θέση έναρξης της μεταγραφής. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ TATA και CAAT box. Επιπλέον, το πλαίσιο TATA έχει μια συναινετική ακολουθία του TATAWAW ενώ το GGCCAATCT είναι η συναινετική ακολουθία του πλαισίου CAAT.
Επιπλέον, μια άλλη σημαντική διαφορά μεταξύ TATA και CAAT κουτιού είναι ότι το κουτί TATA παρέχει μια θέση δέσμευσης για TBP και μεταγραφικούς παράγοντες και συμμετέχει στη ρύθμιση της μεταγραφής, ενώ το πλαίσιο CAAT σηματοδοτεί τη θέση δέσμευσης για τον παράγοντα μεταγραφής RNA.
Το παρακάτω infographic συνοψίζει τις διαφορές μεταξύ του πλαισίου TATA και CAAT.
Σύνοψη – TATA vs CAAT Box
Το Το κουτί TATA και το κουτί CAAT είναι δύο μέρη της διατηρημένης περιοχής των προαγωγέων ευκαρυωτικών γονιδίων. Βρίσκονται ανάντη προς τη θέση έναρξης της μεταγραφής. Και τα δύο επηρεάζουν τη μεταγραφή των γονιδίων παρέχοντας θέσεις για δέσμευση πρωτεϊνών δέσμευσης ΤΑΤΑ και παραγόντων έναρξης μεταγραφής. Το κουτί TATA βρίσκεται 25-35 ζεύγη βάσεων ανάντη της θέσης έναρξης μεταγραφής ενώ το κουτί CAAT βρίσκεται 75-80 ζεύγη βάσεων προς τα πάνω στη θέση έναρξης μεταγραφής. Η συναινετική ακολουθία του πλαισίου TATA είναι TATAWAW ενώ η συναινετική ακολουθία του πλαισίου CAAT είναι GGCCAATCT. Έτσι, αυτή είναι η περίληψη της διαφοράς μεταξύ του πλαισίου TATA και CAAT.
