Η βασική διαφορά μεταξύ ORF και εξωνίου είναι ότι το ORF ή το ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης είναι ένα τμήμα της αλληλουχίας DNA που ξεκινά με τη θέση έναρξης μετάφρασης (κωδόνιο έναρξης) και τελειώνει με τη θέση τερματισμού μετάφρασης (κωδόνιο διακοπής) ενώ το εξόνιο είναι μια αλληλουχία νουκλεοτιδίων μέσα σε ένα γονίδιο που κωδικοποιεί τα αμινοξέα.
Ένα ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης είναι μέρος ενός πλαισίου ανάγνωσης. Τα πλαίσια ανάγνωσης διαβάζονται από τα ριβοσώματα προκειμένου να παραχθούν πρωτεΐνες. Το ORF είναι μια συνεχής έκταση κωδικονίων που δίνει μια πλήρως λειτουργική πρωτεΐνη. Ξεκινά με ένα κωδικόνιο έναρξης και τελειώνει με ένα κωδικόνιο λήξης. Μέσα στο ORF, δεν υπάρχει κωδικόνιο διακοπής που διακόπτει την κωδικοποιητική ακολουθία. Η μετάφραση ξεκινά από το κωδικόνιο έναρξης και τελειώνει στο κωδικόνιο λήξης. Το εξόνιο είναι μια νουκλεοτιδική αλληλουχία ενός γονιδίου. Κωδικοποιεί για τα αμινοξέα της πρωτεΐνης. Επομένως, τα εξόνια είναι κωδικεύουσες περιοχές ενός γονιδίου.
Τι είναι το ORF;
Ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης ή ORF είναι η συνεχής έκταση μιας αλληλουχίας νουκλεοτιδίων που αρχίζει με ένα κωδικόνιο έναρξης και τελειώνει με ένα κωδικόνιο λήξης. Με απλά λόγια, το ORF αναφέρεται στην περιοχή της αλληλουχίας νουκλεοτιδίων που βρίσκεται μεταξύ των κωδικονίων έναρξης και λήξης. Ενδιάμεσα, δεν υπάρχει κωδικόνιο διακοπής που διακόπτει το ORF. Η νουκλεοτιδική αλληλουχία μεταξύ του κωδικονίου έναρξης και λήξης κωδικοποιεί για αμινοξέα. Γενικά, το κωδικόνιο έναρξης είναι ATG ενώ τα κωδικόνια λήξης είναι TAG, TAA και TGA. Το ORF δίνει μια λειτουργική πρωτεΐνη όταν μεταγράφεται και μεταφράζεται. Επομένως, το ORF περιλαμβάνει ένα κωδικόνιο έναρξης, πολλά κωδικόνια στη μεσαία περιοχή και ένα κωδικόνιο λήξης. Είναι ενδιαφέρον ότι το ORF έχει μήκος που μπορεί να διαιρεθεί με τρία.
Εικόνα 01: ORF
Στα προκαρυωτικά, δεδομένου ότι δεν υπάρχουν εσώνια, το ORF είναι η κωδικεύουσα περιοχή ενός γονιδίου που μεταγράφει απευθείας σε mRNA. Στους ευκαρυώτες, καθώς υπάρχουν εσώνια, το ORF είναι η αλληλουχία κωδικονίου που προκύπτει μετά από επεξεργασία ή μάτισμα RNA. Το ORF είναι ένα αποδεικτικό στοιχείο που βοηθά στην πρόβλεψη γονιδίων, καθώς τα μακρά ORF είναι πιθανό να αποτελούν μέρος ενός γονιδίου.
Τι είναι ένα Exon;
Τα εξόνια είναι οι κωδικοποιητικές αλληλουχίες νουκλεοτιδίων γονιδίων που μεταφράζονται σε πρωτεΐνες. Βρίσκονται σε κάθε πλευρά ενός ιντρονίου. Μετά την αφαίρεση των μη κωδικοποιητικών αλληλουχιών από το premRNA, το ώριμο μόριο mRNA αποτελείται μόνο από αλληλουχίες εξονίων. Στη συνέχεια, η αλληλουχία νουκλεοτιδίων του τελικού μορίου RNA (ώριμο mRNA) μετατρέπεται σε μια αλληλουχία αμινοξέων μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης.
Εικόνα 02: Εξόνια
Σχεδόν όλα τα γονίδια έχουν μια αρχική αλληλουχία νουκλεοτιδίων που το διακρίνει ως γονίδιο από τον κύριο κλώνο DNA ή RNA, το οποίο είναι γνωστό ως Ανοιχτό Πλαίσιο Ανάγνωσης (ORF. Σε ορισμένα γονίδια, δύο ORF επισημαίνουν ολόκληρο το γονίδιο και τα εξόνια Αν και ακούγεται ότι τα εξόνια εκφράζονται πάντα σε γονίδια, υπάρχουν περιπτώσεις όπου οι αλληλουχίες ιντρονίων παρεμβαίνουν στο εξόνιο για να προκαλέσουν μεταλλάξεις και αυτή η διαδικασία είναι γνωστή ως εξωνίωση.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ ORF και Exon;
- Τόσο το ORF όσο και το εξόνιο είναι αλληλουχίες νουκλεοτιδίων.
- Το μακρύ ORF και τα εξόνια είναι μέρη ενός γονιδίου.
- Και τα δύο έχουν ακολουθίες κωδικοποίησης.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ ORF και Exon;
Το ORF και το εξόνιο είναι αλληλουχίες νουκλεοτιδίων. Το ORF αναφέρεται σε οποιοδήποτε τμήμα της αλληλουχίας DNA που βρίσκεται μεταξύ ενός κωδικονίου έναρξης και ενός κωδικονίου λήξης. Αντίθετα, το εξόνιο είναι μια κωδικοποιητική αλληλουχία νουκλεοτιδίων ενός γονιδίου που κωδικοποιεί για αμινοξέα. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ ORF και εξωνίου. Τα εξόνια είναι μέρη ενός γονιδίου ενώ το μακρύ ORF είναι πιθανό να είναι μέρος ενός γονιδίου. Επιπλέον, υπάρχουν εσώνια και στις δύο πλευρές ενός εξονίου ενώ το ORF δεν περιλαμβάνει εσώνια.
Το παρακάτω infographic συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ ORF και εξονίου σε μορφή πίνακα.
Σύνοψη – ORF εναντίον Exon
Το ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης (ORF) είναι μέρος του πλαισίου ανάγνωσης. Είναι η συνεχής έκταση της αλληλουχίας DNA που ξεκινά με ένα κωδικόνιο έναρξης και τελειώνει με ένα κωδικόνιο λήξης. Το εξόνιο είναι μια νουκλεοτιδική αλληλουχία ενός γονιδίου. Κωδικοποιεί ένα μέρος της αλληλουχίας mRNA. Επομένως, τα εξόνια είναι μέρη της γονιδιακής αλληλουχίας που εκφράζονται στην πρωτεΐνη. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ ORF και εξονίου.
