Η βασική διαφορά μεταξύ του παράγοντα σίγμα και του παράγοντα rho είναι ότι ο παράγοντας σίγμα είναι μια πρωτεΐνη που απαιτείται για την έναρξη της μεταγραφής στα βακτήρια, ενώ ο παράγοντας rho είναι μια πρωτεΐνη που απαιτείται για τον τερματισμό της μεταγραφής στα βακτήρια.
Ο παράγοντας Sigma και ο παράγοντας rho είναι δύο σημαντικοί παράγοντες για τη βακτηριακή μεταγραφή. Η βακτηριακή μεταγραφή είναι μια διαδικασία κατά την οποία ένα κομμάτι βακτηριακού DNA αντιγράφεται σε έναν νέο κλώνο mRNA (αγγελιοφόρος RNA). Αυτή η διαδικασία καταλύεται από ένα ένζυμο γνωστό ως RNA πολυμεράση. Τα βακτήρια βασίζονται σε μεγάλο βαθμό στη μεταγραφή και τη μετάφραση προκειμένου να ανταποκριθούν σωστά στο περιβάλλον τους. Η βακτηριακή RNA πολυμεράση αποτελείται από έναν πυρήνα και μια δομή ολοενζύμου. Ο πυρήνας περιέχει τις υπομονάδες β, β′, α και 2ω ενώ το ολοένζυμο περιέχει τον παράγοντα σίγμα. Επιπλέον, ένας βοηθητικός παράγοντας της RNA πολυμεράσης γνωστός ως παράγοντας rho είναι επίσης πολύ σημαντικός για τη βακτηριακή μεταγραφή.
Τι είναι το Sigma Factor;
Ο παράγοντας Sigma ή ο παράγοντας ειδικότητας είναι μια πρωτεΐνη που απαιτείται για την έναρξη της μεταγραφής στα βακτήρια. Είναι ένας βακτηριακός παράγοντας έναρξης μεταγραφής. Αυτός ο παράγοντας επιτρέπει τη σύνδεση του ενζύμου RNA πολυμεράσης σε μια συγκεκριμένη περιοχή του DNA που ονομάζεται περιοχή προαγωγέα κατά τη διάρκεια της μεταγραφής. Ο παράγοντας Sigma είναι συνήθως ομόλογος με τον αρχαϊκό μεταγραφικό παράγοντα Β και τον ευκαρυωτικό μεταγραφικό παράγοντα TF11B. Επιπλέον, ο ειδικός παράγοντας σίγμα ενός δεδομένου γονιδίου ποικίλλει ανάλογα με το γονίδιο και τα περιβαλλοντικά σήματα. Οι προαγωγείς επιλέγονται από την RNA πολυμεράση ανάλογα με τον παράγοντα σίγμα που σχετίζεται με αυτήν.
Εικόνα 01: Παράγοντας Sigma
Ο παράγοντας σίγμα μπορεί επίσης να βρεθεί στους χλωροπλάστες των φυτών ως μέρος της πολυμεράσης που κωδικοποιείται από πλαστίδια (PEP). Ο παράγοντας σίγμα και η RNA πολυμεράση συνολικά είναι γνωστά ως ολοένζυμο πολυμεράσης RNA. Το μοριακό βάρος του παράγοντα σίγμα είναι περίπου 70 kDa. Μετά την έναρξη της μεταγραφής, ο παράγοντας σίγμα διαχωρίζεται από το σύμπλοκο. Στη συνέχεια, η RNA πολυμεράση συνεχίζει την επιμήκυνση μέχρι να τερματιστεί η μεταγραφή.
Τι είναι το Rho Factor;
Ο παράγοντας Rho είναι μια προκαρυωτική πρωτεΐνη που εμπλέκεται στον τερματισμό της μεταγραφής. Ο παράγοντας Rho συνήθως συνδέεται με τη θέση παύσης τερματιστή μεταγραφής. Αυτή η θέση είναι μια εκτεθειμένη περιοχή του μονόκλωνου RNA κοντά στο ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης σε αλληλουχίες φτωχές σε γουανίνη πλούσιες σε κυτοσίνη. Είναι μια απαραίτητη πρωτεΐνη μεταγραφής σε προκαρυώτες. Στην Escherichia coli, ο παράγοντας rho είναι περίπου 274,6 kDa εξαμερές πανομοιότυπων υπομονάδων. Κάθε υπομονάδα έχει μια περιοχή δέσμευσης RNA και μια περιοχή υδρόλυσης ATP. Επιπλέον, η λειτουργία του παράγοντα rho είναι η δραστηριότητα ελικάσης.
Εικόνα 02: Rho Factor
Ο Ο παράγοντας Rho συνδέεται με το μόριο RNA και στη συνέχεια χρησιμοποιεί τη δραστηριότητά του ATPase για να παρέχει ενέργεια για τη μετατόπιση των μορίων RNA. Ο παράγοντας Rho πραγματοποιεί μετατόπιση μέχρι να φτάσει στην ελικοειδή περιοχή RNA-DNA, όπου ξετυλίγει την υβριδική (RNA-DNA) διπλή δομή. Αυτή η διαδικασία διακόπτει την πολυμεράση RNA στο σημείο τερματισμού τερματίζοντας τη διαδικασία μεταγραφής.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ του Sigma Factor και του Rho Factor;
- Ο παράγοντας Sigma και ο παράγοντας rho είναι δύο σημαντικοί παράγοντες για τη βακτηριακή μεταγραφή.
- Και τα δύο υπάρχουν μόνο σε προκαρυώτες.
- Είναι πρωτεΐνες που αποτελούνται από αμινοξέα.
- Και οι δύο είναι πρωτεΐνες που δεσμεύουν νουκλεϊκά οξέα.
- Οι προκαρυώτες βασίζονται σε μεγάλο βαθμό σε αυτούς τους παράγοντες για να δημιουργήσουν mRNA που μπορεί να δημιουργήσει περίεργες πρωτεΐνες και να τους βοηθήσει να ανταποκριθούν συγκεκριμένα στο περιβάλλον τους.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Sigma Factor και Rho Factor;
Ο παράγοντας Sigma είναι μια πρωτεΐνη που απαιτείται για την έναρξη της μεταγραφής στα βακτήρια, ενώ ο παράγοντας rho είναι μια πρωτεΐνη που απαιτείται για τον τερματισμό της μεταγραφής στα βακτήρια. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ του παράγοντα sigma και του παράγοντα rho. Επιπλέον, ο παράγοντας σίγμα είναι μια πρωτεΐνη που δεσμεύει DNA, ενώ ο παράγοντας rho είναι μια πρωτεΐνη που δεσμεύει RNA.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τις διαφορές μεταξύ του παράγοντα sigma και του παράγοντα rho σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – Sigma Factor vs Rho Factor
Μεταγραφή είναι η διαδικασία όπου οι πληροφορίες στο DNA αντιγράφονται σε ένα νέο μόριο που ονομάζεται mRNA (αγγελιοφόρος RNA). Αυτό το m-RNA εμπλέκεται τελικά στην παραγωγή μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης. Ο παράγοντας Sigma και ο παράγοντας rho είναι δύο σημαντικοί παράγοντες για τη βακτηριακή μεταγραφή. Είναι πρωτεΐνες. Ο παράγοντας Sigma συμμετέχει στην έναρξη της μεταγραφής στα βακτήρια. Ο παράγοντας Rho είναι υπεύθυνος για τον τερματισμό της μεταγραφής στα βακτήρια. Έτσι, αυτή είναι η περίληψη της διαφοράς μεταξύ του παράγοντα σίγμα και του παράγοντα rho.
