Βασική διαφορά – Πρότυπο vs Κώδικας Κωδικοποίησης
Σε πολλούς οργανισμούς, το DNA λειτουργεί ως αποθήκη πληροφοριών, ενώ το RNA ως ο αγγελιοφόρος. Η διαδικασία της σύνθεσης του RNA από το DNA είναι γνωστή ως μεταγραφή, η οποία ελέγχει τη γονιδιακή έκφραση και την παραγωγή πρωτεϊνών σε πολλά βιολογικά συστήματα. Σε αυτή τη διαδικασία, σε δύο κλώνους DNA δίνονται συγκεκριμένα ονόματα με βάση τη συμμετοχή τους. Ο κλώνος προτύπου είναι ο κλώνος DNA που λειτουργεί ως πρότυπο για τη σύνθεση RNA ενώ ο άλλος κλώνος ονομάζεται κωδικοποιητικός κλώνος. Η βασική διαφορά μεταξύ αυτών των δύο κλώνων είναι ότι ο κλώνος μήτρας έχει την αντίθετη ακολουθία βάσης του RNA ενώ ο κωδικεύων κλώνος έχει την ίδια βασική αλληλουχία RNA (με εξαίρεση τη θυμίνη αντί της ουρακίλης). Δεν μεταγράφονται όλοι οι κλώνοι DNA σε ένα κύτταρο σε RNA. Η μεταγραφή συνθέτει όλους τους τύπους RNA συμπεριλαμβανομένων των mRNA, tRNA, rRNA, snRNA, miRNA και siRNA. Υπάρχουν λίγες διαφορές στη μεταγραφή του RNA μεταξύ προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών. Για παράδειγμα, στους ευκαρυώτες, η διαδικασία μεταγραφής είναι πολύ πιο περίπλοκη από ότι στα προκαρυωτικά λόγω της εμπλοκής μεγάλου αριθμού μεταγραφικών παραγόντων. Ωστόσο, ο στόχος αυτού του άρθρου είναι να εκφράσει τη διαφορά μεταξύ του κλώνου προτύπου και του σκέλους κωδικοποίησης.
Τι είναι το Template Strand;
Ο κλώνος του προτύπου είναι ο κλώνος DNA, ο οποίος λειτουργεί ως πρότυπο για τη σύνθεση του RNA. Η RNA πολυμεράση διαβάζει αυτόν τον κλώνο από το 3' έως το 5. Ο κλώνος του προτύπου δεν εμπλέκεται στην κωδικοποίηση, επομένως αναφέρεται ως μη κωδικοποιητικός κλώνος. Η νουκλεοτιδική αλληλουχία του κλώνου του εκμαγείου είναι συμπληρωματική προς το μόριο mRNA και τον κωδικοποιητικό κλώνο.
Τι είναι το Coding Strand;
Ο κωδικοποιητικός κλώνος καθορίζει την αλληλουχία του κλώνου RNA. Ο κωδικεύων κλώνος έχει την ίδια νουκλεοτιδική αλληλουχία RNA με εξαίρεση την Ουρακίλη αντί για τη Θυμίνη. Ο κωδικοποιητικός κλώνος αναφέρεται επίσης ως κλώνος νόημα επειδή καθορίζει την αλληλουχία RNA που κωδικοποίησε τελικά μια συγκεκριμένη αλληλουχία αμινοξέων πρωτεΐνης. Αυτό το σκέλος διαβάζεται στον σκηνοθέτη από το τέλος του 5 έως το τέλος του 3ου. Το άκρο 5' περιέχει τη φωσφορική ομάδα συνδεδεμένη με 5' άτομο άνθρακα, ενώ το 3' άκρο έχει τη φωσφορική ομάδα συνδεδεμένη με 3' άτομο άνθρακα ή την ομάδα υδροξυλίου, εάν βρίσκεται στο τέλος της αλυσίδας DNA.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Template και Coding Strand;
Λειτουργία:
Template Strand: Η κλώνος του προτύπου λειτουργεί ως πρότυπο για τη σύνθεση RNA.
Κωδικοποιητικός κλώνος: Ο κωδικοποιητικός κλώνος έχει την ίδια αλληλουχία του RNA που μόλις συντέθηκε.
Άλλα ονόματα:
Template Strand: Το σκέλος του προτύπου ονομάζεται επίσης αντιπληροφοριακό σκέλος ή [-] σκέλος.
Σύστημα κωδικοποίησης: Το σκέλος κωδικοποίησης είναι γνωστό ως σκέλος αίσθησης, [+] ή σκέλος χωρίς πρότυπο.
Ακολουθία βάσης:
Template Strand: Ο κλώνος του προτύπου είναι συμπληρωματικός του RNA που συντίθεται.
Κωδικοποιητικός κλώνος: Η αλληλουχία RNA είναι ίση με τον κωδικοποιητικό κλώνο του DNA με την παρουσία Θυμίνης αντί Ουρακίλης.
