Η βασική διαφορά μεταξύ Cosmid και Phagemid είναι στον τύπο των αλληλουχιών που περιέχει. Ένα Κοσμίδιο περιέχει μια θέση cos και ένα πλασμίδιο. Επομένως, είναι ένας υβριδικός φορέας ενώ ένα Φαγομίδιο είναι ένα πλασμίδιο που περιέχει μια αρχή αντιγραφής F1 του φάγου F1.
Τα κοσμίδια και τα φαγομίδια χρησιμοποιούνται για σκοπούς κλωνοποίησης, ειδικά για την κλωνοποίηση μεγαλύτερων θραυσμάτων DNA. Αυτά χρησιμοποιούνται ευρέως ειδικά στην κλωνοποίηση γονιδίων που είναι υπεύθυνα για την παραγωγή διαφόρων πρωτεϊνών. Τα κοσμίδια και τα φαγομίδια είτε αντιγράφονται μόνα τους ως πλασμίδια είτε συσκευάζονται σε ιικά σωματίδια και στη συνέχεια αντιγράφονται.
Τι είναι ένα Cosmid;
Ένα κοσμίδιο, που αναφέρεται ως υβριδικό πλασμίδιο, περιλαμβάνει θέσεις cos που εκχυλίζονται από σωματίδια φάγου Λάμδα και ένα πλασμίδιο. Αυτές οι θέσεις cos είναι μακρά θραύσματα DNA με 200 ζεύγη βάσεων. Ως εκ τούτου, έχουν συνεκτικά ή κολλώδη άκρα που επιτρέπουν στο πλασμίδιο να ταιριάζει στο ιικό DNA. Επομένως, οι τοποθεσίες cos είναι ζωτικής σημασίας για τη συσκευασία του DNA.
Υπάρχουν τρεις ιστότοποι cos;
- cosN θέση – εμπλέκεται στη κοπή του κλώνου του DNA μέσω της δραστηριότητας τερματισμού
- ιστότοπος cosB – ασχολείται με τη διατήρηση της τερμινάσης.
- cosQ θέση – εμπλέκεται στην πρόληψη της αποικοδόμησης του DNA από τις DNases.
Εικόνα 01: Cosmid
Επίσης, τα Cosmids μπορούν είτε να αντιγράψουν μονόκλωνο DNA είτε δίκλωνο DNA χρησιμοποιώντας κατάλληλη αρχή αντιγραφής. Τα κοσμίδια συνήθως περιέχουν γονίδια ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά ως δείκτες για την επιλογή μετασχηματιστών. Έτσι, η χρήση ενός κοσμιδίου ως φορέα μπορεί να διευκολύνει την κλωνοποίηση και η πέψη του φορέα με περιοριστικά ένζυμα μπορεί στη συνέχεια να εξαγάγει αυτά τα θραύσματα.
Τι είναι ένα Φαγομίδιο (Φασμίδιο);
Το Phagemid, που ονομάζεται επίσης Phasmid, είναι επίσης ένας τύπος υβριδικού φορέα. Το φαγομίδιο περιέχει μια ειδική αρχή αντιγραφής που ονομάζεται αρχή αντιγραφής f1. Η αρχή f1 της αντιγραφής εκχυλίζεται από έναν φάγο f1.
Το Το φαγομίδιο μπορεί να αντιγράψει τόσο μονόκλωνο όσο και δίκλωνο DNA. Η αντιγραφή μπορεί είτε να λάβει χώρα ως πλασμίδιο ενώ υφίσταται ανεξάρτητη αντιγραφή είτε μπορεί να συσκευαστεί σε σωματίδια φάγου και τελικά να μολύνει τον βακτηριακό ξενιστή E coli. Όταν μολύνονται τα κύτταρα E coli, ο φάγος f1 απαιτεί την παρουσία ενός πυλώνα. Ως εκ τούτου, οι σεξουαλικές φυλές είναι σημαντικές κατά την in vitro συσκευασία των Phagemids.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ Cosmid και Phagemid;
- Τόσο το Cosmid όσο και το Phagemid είναι φορείς κλωνοποίησης που χρησιμοποιούνται στην τεχνολογία ανασυνδυασμένου DNA.
- Cosmid και Phagemid μπορούν να αντιγράψουν μονόκλωνο και δίκλωνο DNA.
- Και τα δύο μπορούν να υποστούν ανεξάρτητη αντιγραφή παρόμοια με τα πλασμίδια.
- Cosmid και Phagemid μπορούν να υποστούν in vitro συσκευασία και να μολύνουν βακτηριακά κύτταρα.
- Τόσο το Cosmid όσο και το Phagemid απαιτούν κατάλληλη αρχή αντιγραφής για την κλωνοποίηση.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ κοσμιδίου και φαγομιδίου;
Cosmid vs Phagemid |
|
| Το Cosmid είναι ένας υβριδικός φορέας που περιέχει μια θέση cos και ένα πλασμίδιο. | Το φαγομίδιο είναι ένα πλασμίδιο που περιέχει μια αρχή αντιγραφής F1 του φάγου F1. |
| Παρουσία τοποθεσιών Cos | |
| Οι τοποθεσίες Cos υπάρχουν στο cosmid και είναι απαραίτητες για συσκευασία in vitro. | Γιατί οι τοποθεσίες Cos απουσιάζουν στο φαγομίδιο. |
| Παρουσία F1 Origin of Replication | |
| Στο cosmid, η αρχή αντιγραφής fi μπορεί να είναι ή να μην υπάρχει. | Η αρχή αντιγραφής F1 υπάρχει στο φαγομίδιο. |
| Παρουσία ανθεκτικών γονιδίων στα αντιβιοτικά | |
| Γονίδια ανθεκτικά στα αντιβιοτικά υπάρχουν στα κοσμίδια για την ταυτοποίηση των μετασχηματιστών από τα μη μετασχηματισμένα. | Τα γονίδια ανθεκτικά στα αντιβιοτικά απουσιάζουν στα φαγομίδια. |
| Απαίτηση συσκευασίας In Vitro | |
| Απαιτείται ιστότοπος cos. | Απαιτείται σεξουαλική πείρα. |
Σύνοψη – Cosmid vs Phagemid
Το Cosmid και Phagemid είναι φορείς κλωνοποίησης που χρησιμοποιούνται στην τεχνολογία ανασυνδυασμένου DNA. Τα κοσμίδια είναι υβριδικοί φορείς που περιέχουν ειδικά κολλώδη άκρα γνωστά ως θέσεις cos. Οι συσκευασίες in vitro απαιτούν αυτές τις τοποθεσίες cos. Ενώ τα φαγομίδια είναι πλασμίδια που περιέχουν μια αρχή αντιγραφής f1 που εξάγεται από τον φάγο f1. Τόσο το κοσμίδιο όσο και το φαγομίδιο μπορούν να υποστούν ανεξάρτητη αντιγραφή ή in vitro συσκευασία σε βακτηριακά κύτταρα. Αυτές είναι οι σημαντικές διαφορές μεταξύ κοσμιδίου και φαγομιδίου.
