Η βασική διαφορά μεταξύ των περιοριστικών ενζύμων EcoRI και HindIII είναι ότι το EcoRI είναι ένα περιοριστικό ένζυμο τύπου II που απομονώνεται από το E. coli, ενώ το HindIII είναι ένα περιοριστικό ένζυμο τύπου II που απομονώνεται από το Haemophilus influenza.
Το ένζυμο περιορισμού ή η περιοριστική ενδονουκλεάση είναι ένα ένζυμο που διασπά το DNA σε θραύσματα σε συγκεκριμένες θέσεις αναγνώρισης (θέσεις περιορισμού) εντός του μορίου DNA. Αυτά τα περιοριστικά ένζυμα βρίσκονται σε βακτήρια και αρχαία. Παρέχουν έναν αμυντικό μηχανισμό ενάντια στους εισβολείς ιούς. Τα περιοριστικά ένζυμα ταξινομούνται γενικά σε πέντε διαφορετικούς τύπους: τύπου Ι, τύπου II, τύπου III, IV και τύπου V. Το EcoRI και το HindIII είναι δύο περιοριστικά ένζυμα που ανήκουν στην ομάδα των περιοριστικών ενζύμων τύπου II.
Τι είναι τα ένζυμα περιορισμού EcoRI;
Το EcoRI είναι ένα ένζυμο περιορισμού τύπου II που απομονώνεται από είδη E.coli. Είναι ένα ένζυμο περιορισμού που διασπά τις διπλές έλικες του DNA σε θραύσματα σε συγκεκριμένες θέσεις. Το EcoRI είναι επίσης μέρος του συστήματος περιορισμού-τροποποίησης. Το EcoRI ήταν το πρώτο ένζυμο που απομονώθηκε αρχικά από το στέλεχος RY13 του είδους E. coli. Χρησιμοποιείται ως ένζυμο περιορισμού στη μοριακή βιολογία. Το EcoRI δημιουργεί 4 κολλώδη άκρα νουκλεοτιδίων με 5' ακραίες προεξοχές AATT. Το EcoRI κόβει το DNA στη συγκεκριμένη αλληλουχία αναγνώρισης G↓AATTC. Έχει την παλινδρομική συμπληρωματική ακολουθία του CTTAA↓G. Επιπλέον, αυτό το ένζυμο περιορισμού ανήκει στην υποκατηγορία τύπου II P (παλινδρομική ειδικότητα). Στην κύρια δομή του, το EcoRI περιέχει το μοτίβο PD. D/EXK εντός της ενεργής του θέσης, όπως πολλά άλλα περιοριστικά ένζυμα.
Εικόνα 01: EcoRI
Το ένζυμο περιορισμού EcoRI είναι ένα ομοδιμερές 31 kDa. Περιέχει ένα σφαιρικό πεδίο της αρχιτεκτονικής α/β. Κάθε υπομονάδα περιέχει έναν βρόχο που προεξέχει από τη σφαιρική περιοχή και τυλίγεται γύρω από το DNA όταν συνδέεται. Αυτό το ένζυμο μπορεί να συνκρυσταλλωθεί με την αλληλουχία που συνήθως κόβει. Επιπλέον, το ένζυμο περιορισμού EcoRI χρησιμοποιείται σε μια ευρεία ποικιλία τεχνικών μοριακής γενετικής, συμπεριλαμβανομένης της κλωνοποίησης, της διαλογής DNA και των τμημάτων διαγραφής των συνθηκών DNA in vitro.
Τι είναι τα ένζυμα περιορισμού HindIII;
Το
HindIII είναι ένα ένζυμο περιορισμού τύπου II που απομονώνεται από είδη Haemophilus influenza. Διασπά την παλινδρομική αλληλουχία DNA AACCTT παρουσία του συμπαράγοντα Mg2+ μέσω υδρόλυσης. Η διάσπαση αυτής της συγκεκριμένης αλληλουχίας μεταξύ των AA'S (5'A↓ACCTT3' και 3'TTCGA↓A5') έχει ως αποτέλεσμα προεξοχές 5' στο μόριο DNA που ονομάζονται κολλώδη άκρα. Αυτό το ένζυμο βρίσκεται σε προκαρυωτικούς οργανισμούς όπως τα βακτήρια. Τα βακτήρια χρησιμοποιούν αυτό το ένζυμο ως αμυντικό μηχανισμό έναντι ιών όπως οι βακτηριοφάγοι.
Εικόνα 02: HindIII
Δομικά, το HindIII είναι ένα ομοδιμερές. Περιέχει έναν κοινό δομικό πυρήνα που περιλαμβάνει τέσσερα φύλλα β και μία έλικα α, όπως άλλοι τύποι ενζύμων περιορισμού II. Η μοριακή μάζα αυτού του ενζύμου είναι 34,9 kDa. Επιπλέον, το HindIII είναι πολύ χρήσιμο σε σύγχρονα πειράματα μοριακής βιολογικής επιστήμης όπως η αλληλουχία DNA και η χαρτογράφηση.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ των ενζύμων περιορισμού EcoRI και HindIII;
- EcoRI και HindIII είναι δύο περιοριστικά ένζυμα που ανήκουν στην ομάδα των περιοριστικών ενζύμων τύπου II.
- Το EcoRI και HindIII βρέθηκαν στις αρχές της δεκαετίας του 1970.
- Το EcoRI και το HindIII περιέχουν και τα δύο το μοτίβο της αλληλουχίας αμινοξέων PD.. D/EXK.
- Και τα δύο περιοριστικά ένζυμα πραγματοποιούν πολύ ειδική διάσπαση του DNA.
- Αυτά τα περιοριστικά ένζυμα χρειάζονται Mg2+ ως συμπαράγοντα για τη συγκεκριμένη δραστηριότητά τους.
- Δημιουργούν κολλώδη άκρα μετά την κοπή του DNA.
- Είναι πολύ χρήσιμα συστατικά στη σύγχρονη μοριακή βιολογική έρευνα.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ των ενζύμων περιορισμού EcoRI και HindIII;
Το EcoRI είναι ένα περιοριστικό ένζυμο τύπου II που απομονώνεται από είδη E.coli, ενώ το HindIII είναι ένα περιοριστικό ένζυμο τύπου II που απομονώνεται από είδη Haemophilus influenza. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ EcoRI και HindIII. Επιπλέον, το EcoRI κόβει το DNA στη συγκεκριμένη αλληλουχία αναγνώρισης G↓AATTC, ενώ το HindIII κόβει το DNA στη συγκεκριμένη αλληλουχία αναγνώρισης A↓ACCTT.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τις διαφορές μεταξύ EcoRI και HindIII σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – EcoRI vs HindIII περιοριστικά ένζυμα
Το EcoRI και HindIII είναι δύο ένζυμα περιορισμού που ανήκουν στην υποκατηγορία p τύπου II. Εκτελούν πολύ συγκεκριμένη διάσπαση του DNA. Το EcoRI είναι ένα ένζυμο περιορισμού τύπου II που απομονώνεται από είδη E.coli, ενώ το HindIII είναι ένα περιοριστικό ένζυμο τύπου II που απομονώνεται από είδη Haemophilus influenza. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ EcoRI και HindIII.
