Η βασική διαφορά μεταξύ snRNA και snRNP είναι ότι τα snRNA είναι μικρά μόρια πυρηνικού RNA ενώ τα snRNP ή μικρές πυρηνικές ριβονουκλεοπρωτεΐνες είναι μικρά μόρια πυρηνικού RNA με πρωτεΐνες.
Τα snRNA είναι μη κωδικοποιητικά, βιολογικά ενεργά μικρά μόρια RNA με μέσο μέγεθος 150 νουκλεοτιδίων. Συνήθως υπάρχουν σε συνδυασμό με πρωτεΐνες ως snRNPs στη φυσική τους κατάσταση. Ως εκ τούτου, τα snRNPs είναι μικρό πυρηνικό RNA με αρκετές ειδικές για το snRNP πρωτεΐνες. Τα snRNP εμπλέκονται στη μεσολάβηση ή τη ρύθμιση μετα-μεταφραστικών γεγονότων επεξεργασίας RNA, όπως το μάτισμα, κ.λπ. Τόσο το snRNA όσο και το snRNP βρίσκονται στον πυρήνα των ευκαρυωτικών κυττάρων.
Τι είναι το snRNA;
Το snRNA σημαίνει μικρό πυρηνικό RNA. Είναι μικρά μόρια πυρηνικού RNA που βρίσκονται μέσα στα στίγματα ματίσματος και στα σώματα Cajal του κυτταρικού πυρήνα στα ευκαρυωτικά κύτταρα. Ένα μόριο snRNA έχει μέσο μήκος 150 νουκλεοτίδια. Αυτά τα snRNA μεταγράφονται από τα pol II και pol III. Η κύρια λειτουργία του snRNA είναι η επεξεργασία του προ-αγγελιοφόρου RNA (hnRNA) στον πυρήνα. Εμπλέκονται κυρίως στη μεσολάβηση ή τη ρύθμιση μετα-μεταφραστικών γεγονότων επεξεργασίας RNA όπως το μάτισμα. Λόγω της δράσης του snRNA, λαμβάνει χώρα ακριβής ευθυγράμμιση και σωστή εκτομή των ιντρονίων. Επιπλέον, τα snRNA συμμετέχουν στη ρύθμιση των μεταγραφικών παραγόντων (7SK RNA) ή της RNA πολυμεράσης II (B2 RNA) και στη διατήρηση των τελομερών.
Εικόνα 01: snRNA
Τα snRNA είναι μη κωδικοποιητικά RNA. Ανήκουν σε μια κατηγορία βιολογικά ενεργού RNA υψηλής αφθονίας που εντοπίζεται στον πυρήνα. Συνδέονται πάντα με μόρια πρωτεΐνης και υπάρχουν ως μικρές πυρηνικές ριβονουκλεοπρωτεΐνες (snRNP). Υπάρχουν δύο κύριοι τύποι snRNA ως snRNA κατηγορίας Sm και snRNA κατηγορίας Lsm. Τα U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 και U12 είναι snRNA κατηγορίας Sm ενώ τα U6 και U6atac είναι snRNA κατηγορίας Lsm.
Τι είναι το snRNP;
Το snRNP είναι ένα μικρό πυρηνικό μόριο RNA σε συνδυασμό με πρωτεΐνες. Γενικά, κάθε snRNP περιέχει ένα μόνο snRNA και πολλά μόρια πρωτεΐνης. Επομένως, τα snRNPs είναι μικρά πυρηνικά μόρια και πρωτεΐνες RNA. Τα snRNP, μαζί με πολλές άλλες επιπρόσθετες πρωτεΐνες, σχηματίζουν το σύμπλεγμα που ονομάζεται μάτισμα όπου λαμβάνει χώρα το μάτισμα του RNA. Τα snRNP χρειάζονται τόσο το τμήμα RNA όσο και το τμήμα πρωτεΐνης για να ματίσουν τα ιντρόνια. Το συστατικό RNA είναι υπεύθυνο για τις περικοπές της ενδονουκλεάσης αφού έχει ενζυματική δράση. Υπάρχουν διαφορετικοί τύποι snRNP και κόβονται σε διαφορετικές τοποθεσίες.
Εικόνα 02: snRNP στο Spliceosome
Εκτός από το μάτισμα, τα snRNP συμμετέχουν στην πυρηνική ωρίμανση των πρωτογενών μεταγραφών σε mRNAs, στη ρύθμιση της έκφρασης γονιδίων, στον δότη ματίσματος σε μη κανονικά συστήματα και στην επεξεργασία 3'-άκρου mRNA ιστονών που εξαρτώνται από την αναπαραγωγή. Υπάρχουν δύο ειδικές ομάδες snRNPs, όπως τα μικρά πυρηνικά RNPs (snoRNPs) και τα μικρά Cajal-body RNPs (scaRNPs).
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ snRNA και snRNP;
- Τόσο το snRNA όσο και το snRNP έχουν μικρά πυρηνικά μόρια RNA.
- Τα snRNA συνδυάζονται με πρωτεΐνες για να δημιουργήσουν snRNP.
- Κάθε snRNP περιέχει ένα μεμονωμένο snRNA.
- Τόσο το snRNA όσο και το snRNP βρίσκονται στον πυρήνα των ευκαρυωτικών κυττάρων.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ snRNA και snRNP;
Το snRNA είναι ένα μικρό μη κωδικοποιητικό μόριο RNA που εντοπίζεται στον πυρήνα του ευκαρυωτικού κυττάρου, ενώ το snRNP είναι ένα σύμπλεγμα ενός μοναδικού snRNA και ειδικών πρωτεϊνών snRNP. Τα snRNPS είναι μικρά σωματίδια πυρηνικής ριβονουκλεοπρωτεΐνης. Το snRNA είναι απλώς ένα μικρό μόριο RNA ενώ το snRNP είναι ένα σύμπλεγμα μορίου snRNA και στενά συνδεδεμένων πρωτεϊνών. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ snRNA και snRNP.
Το παρακάτω infographic δείχνει τις διαφορές μεταξύ snRNA και snRNP σε μορφή πίνακα.
Σύνοψη – snRNA vs snRNP
Το snRNA είναι μια κατηγορία μη κωδικοποιητικού μικρού πυρηνικού RNA που εντοπίζεται στον ευκαρυωτικό πυρήνα. Εκπληρώνουν σημαντικές λειτουργίες που σχετίζονται με το μάτισμα ιντρονίων και την άλλη επεξεργασία RNA. Στη φυσική κατάσταση, το snRNA συνδέεται με πρωτεΐνες και υπάρχει ως μικρά σωματίδια πυρηνικής ριβονουκλεοπρωτεΐνης (snRNPs). Τα snRNPs, μαζί με πολλές άλλες πρωτεΐνες, εμπλέκονται στο σχηματισμό του συμπλέγματος ματίσματος προκειμένου να πραγματοποιηθεί το μάτισμα του RNA. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ snRNA και snRNP.