Η βασική διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA είναι ότι το snRNA περιλαμβάνει το εναλλακτικό μάτισμα του pre-mRNA ενώ το snoRNA περιλαμβάνει την τροποποίηση του rRNA και του tRNA, την επεξεργασία του mRNA και την αποτύπωση γονιδιώματος.
Το μικρό RNA είναι πολυμερή μόρια RNA που αποτελούνται από λιγότερα από 200 νουκλεοτίδια. Συνήθως δεν κωδικοποιούν. Υπάρχουν μεταξύ των αγγελιαφόρων RNA για να μεταφέρουν σήματα. Τα μικρά RNA προέρχονται από τέλειο δίκλωνο RNA, το οποίο παράγεται από τη δράση της εξαρτώμενης από RNA πολυμεράσης RNA. Τα μικρά RNA παίζουν σημαντικό ρόλο στην κυτταρική διαφοροποίηση, ανάπτυξη και πολλαπλασιασμό, απόπτωση, μεταβολισμό, μετανάστευση και άμυνα. Επομένως, τα μικρά RNA είναι σημαντικοί και κρίσιμοι ρυθμιστές της ανάπτυξης και της φυσιολογίας. Το μικρό πυρηνικό RNA και το μικρό πυρηνικό RNA είναι δύο κατηγορίες μικρών μορίων RNA.
Τι είναι το snRNA;
Το μικρό πυρηνικό RNA ή snRNA είναι μια κατηγορία μικρών μορίων RNA που βρίσκονται στον πυρήνα των ευκαρυωτικών κυττάρων. Το μέσο μήκος ενός snRNA είναι περίπου 150 νουκλεοτίδια. Η RNA πολυμεράση II ή η RNA πολυμεράση III μεταγράφουν το snRNA. Η κύρια λειτουργία του snRNA είναι η επεξεργασία του προ-αγγελιοφόρου RNA στον πυρήνα. Βοηθούν επίσης στη ρύθμιση των μεταγραφικών παραγόντων ή της RNA πολυμεράσης II και στη διατήρηση των τελομερών.
Εικόνα 01: Μηχανισμός δράσης μικρού RNA
Υπάρχουν δύο κατηγορίες snRNA που βασίζονται σε κοινά χαρακτηριστικά αλληλουχίας και σχετικούς πρωτεϊνικούς παράγοντες όπως η πρωτεΐνη LSm που δεσμεύει το RNA. Οι δύο κατηγορίες είναι snRNA κατηγορίας Sm και snRNA κατηγορίας Lsm. Το snRNA της κατηγορίας Sm αποτελείται από υψηλή περιεκτικότητα ουριδίνης σε U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 και U12. Η RNA πολυμεράση II μεταγράφει το snRNA κατηγορίας SM. Μετά τη μεταγραφή του pre-snRNA, συνήθως λαμβάνουν ένα κάλυμμα 7-μεθυλγουανοσίνης 5' στον πυρήνα. Στη συνέχεια εξάγονται στο κυτταρόπλασμα μέσω πυρηνικών πόρων για περαιτέρω επεξεργασία. Το snRNA της κατηγορίας Lsm έχει υψηλή περιεκτικότητα σε ουριδίνη U6 και U6atac. Η RNA πολυμεράση III μεταγράφει το snRNA της κατηγορίας Lsm και δεν φεύγει από τον πυρήνα. Τα πιο κοινά συστατικά του ανθρώπινου snRNA είναι το ματοσωμικό RNA U1, το συρματοσωμικό RNA U2, το συρματοσωμικό RNA U4, το συρματοσωμικό RNA U5 και το συρματοσωματικό RNA U6.
Τι είναι το snoRNA;
Το μικρό πυρηνικό RNA ή snoRNA είναι μια κατηγορία μικρών μορίων RNA που καθοδηγούν τις χημικές τροποποιήσεις σε άλλα RNA όπως το ριβοσωμικό RNA, το RNA μεταφοράς και το μικρό πυρηνικό RNA. Κάθε μόριο snoRNA συνδέεται με περίπου τέσσερις πρωτεΐνες πυρήνων στο σύμπλεγμα RNA/πρωτεΐνης κατά τη διάρκεια της διαδικασίας τροποποίησης. Το snoRNA περιέχει ένα αντιπληροφοριακό στοιχείο που είναι περίπου 10-20 νουκλεοτίδια. Αυτές οι βάσεις είναι συμπληρωματικές με την αλληλουχία που περιβάλλει τα νουκλεοτίδια που στοχεύουν την τροποποίηση στο μόριο προ-RNA.
Εικόνα 02: Μικρό Πυρηνικό RNA
Υπάρχουν δύο κατηγορίες snoRNA. Είναι το C/D box snoRNA και H/ACA box snoRNA. Το C/D box snoRNA σχετίζεται με μεθυλίωση και το H/ACA box snoRNA σχετίζεται με ψευδοουριδυλίωση. Κάθε μόριο snoRNA λειτουργεί ως οδηγός για μία ή δύο τροποποιήσεις σε ένα RNA στόχο. Το snoRNA του κουτιού C/D περιέχει δύο σύντομες διατηρημένες αλληλουχίες μοτίβα C και D, κοντά στα άκρα 5' και 3' του snoRNA, αντίστοιχα. Μικρές περιοχές που αποτελούνται από 5 νουκλεοτίδια διατάσσονται ανάντη του πλαισίου C και κατάντη του πλαισίου D και σχηματίζουν μια δομή κορμού-κουτιού. Αυτό φέρνει τα μοτίβα του κουτιού C και D σε κοντινή απόσταση. Η δομή του στελέχους είναι σημαντική για τη σωστή σύνθεση snoRNA και τον πυρηνικό εντοπισμό. Το H/ACA box snoRNA έχει μια δευτερεύουσα δομή που αποτελείται από δύο φουρκέτες και δύο μονόκλωνες περιοχές. Αυτό είναι κοινώς γνωστό ως δομή φουρκέτας-άρθρωσης-φουρκέτας-ουράς. Το H/ACA box snoRNA αποτελείται επίσης από δύο διατηρημένα μοτίβα H και ACA. Και οι δύο βρίσκονται σε μονόκλωνες περιοχές. Το κουτί H βρίσκεται στον μεντεσέ και το ACA στην περιοχή της ουράς. Τρία νουκλεοτίδια σχηματίζουν το 3' άκρο της αλληλουχίας.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ snRNA και snoRNA;
- snRNA και snoRNA είναι μικρά RNA.
- Και τα δύο υπάρχουν στα ευκαρυωτικά κύτταρα.
- Και τα δύο είναι μη κωδικοποιητικά μόρια RNA.
- Επιπλέον, συμμετέχουν στην τροποποίηση του RNA κατά τη διαδικασία της μεταγραφής.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA;
Το snRNA συμμετέχει στο εναλλακτικό μάτισμα του pre-mRNA ενώ το snoRNA τροποποιεί κυρίως τα μόρια RNA. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA. Επιπλέον, τα snRNA έχουν μήκος περίπου 150 νουκλεοτίδια και συχνά βρίσκονται συνδεδεμένα με μια ομάδα πρωτεϊνών και συμπλεγμάτων που ονομάζονται μικρές πυρηνικές ριβονουκλεοπρωτεΐνες. Τα snoRNAs έχουν μήκος περίπου 60-170 νουκλεοτίδια και βρίσκονται κυρίως στον πυρήνα.
Επιπλέον, τα snRNA μεταγράφονται είτε από την RNA πολυμεράση II είτε από την RNA πολυμεράση III, ενώ το snoRNA μεταγράφεται μόνο από την RNA πολυμεράση II.
Το παρακάτω infographic παρουσιάζει τις διαφορές μεταξύ snRNA και snoRNA σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – snRNA vs snoRNA
Το snRNA και το snoRNA είναι κατηγορίες μικρών μορίων RNA. Το snRNA συμμετέχει στο εναλλακτικό μάτισμα του pre-mRNA ενώ το snoRNA τροποποιεί κυρίως τα μόρια RNA. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA. Το μικρό RNA είναι πολυμερή μόρια RNA που αποτελούνται από λιγότερα από 200 νουκλεοτίδια σε μήκος και συνήθως δεν κωδικοποιούν. Τα snRNA βρίσκονται στον πυρήνα των ευκαρυωτών. Τα snoRNA βρίσκονται σε αρχαία και ευκαρυώτες. Η μεταγραφή του snRNA λαμβάνει χώρα μέσω της RNA πολυμεράσης II και II, ενώ μόνο η RNA πολυμεράση II εμπλέκεται στη μεταγραφή του snoRNA. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA.
