Η βασική διαφορά μεταξύ tRNA αμινοακυλίου και πεπτιδυλικού tRNA είναι ότι το αμινοακυλο tRNA είναι ένα μόριο tRNA συνδεδεμένο στη θέση Α του ριβοσώματος ενώ το πεπτιδυλικό tRNA είναι ένα μόριο tRNA συνδεδεμένο στη θέση P του ριβοσώματος.
Το RNA μεταφοράς (tRNA) είναι ένα μόριο RNA που βοηθά στην αποκωδικοποίηση μιας αλληλουχίας αγγελιαφόρου RNA (mRNA) σε πρωτεΐνη. Στη σύνθεση πρωτεϊνών, το μόριο tRNA κάνει ζεύγη βάσεων με τη συμπληρωματική αλληλουχία του στο mRNA (αγγελιοφόρος RNA). Αυτό εξασφαλίζει ότι το κατάλληλο αμινοξύ εισάγεται στην αναπτυσσόμενη πολυπεπτιδική αλυσίδα (μόριο πρωτεΐνης). Επομένως, το tRNA είναι ένα βασικό συστατικό για το στάδιο μετάφρασης της πρωτεϊνοσύνθεσης. Το αμινοακυλο tRNA και το πεπτιδυλο tRNA είναι δύο τύποι μορίων tRNA που συμμετέχουν στο στάδιο μετάφρασης της πρωτεϊνικής σύνθεσης.
Τι είναι το Aminoacyl tRNA;
Το αμινοακυλο tRNA είναι ένα μόριο tRNA που φέρει ένα μόνο αμινοξύ στο άκρο. Συνήθως δεσμεύεται στην γειτονική θέση Α του ριβοσώματος. Το αμινοακυλο tRNA, μαζί με συγκεκριμένους παράγοντες επιμήκυνσης, παρέχει το συγκεκριμένο αμινοξύ στο ριβόσωμα για ενσωμάτωση στην πολυπεπτιδική αλυσίδα κατά τη μετάφραση. Κάθε αμινοξύ έχει το δικό του ειδικό ένζυμο συνθετάσης αμινοακυλο tRNA. Αυτό το ένζυμο χρησιμοποιείται από αμινοξέα για να συνδεθεί χημικά στο συγκεκριμένο tRNA. Η σύνδεση ενός tRNA με το συγγενές του αμινοξύ είναι κρίσιμη. Αυτό διασφαλίζει ότι μόνο το συγκεκριμένο αμινοξύ που ταιριάζει με το αντικωδικόνιο του tRNA χρησιμοποιείται κατά τη διάρκεια της πρωτεϊνικής σύνθεσης. Προκειμένου να αποφευχθούν μεταφραστικά σφάλματα, το ένζυμο αμινοακυλο tRNA συνθετάση έχει ικανότητα διόρθωσης. Τα αμινοξέα που είναι κακοακυλιωμένα με το κατάλληλο μόριο tRNA συνήθως υποβάλλονται σε υδρόλυση. Αυτό πραγματοποιείται με τον μηχανισμό αποακυλίωσης του ενζύμου αμινοακυλο tRNA συνθετάσης. Επιπλέον, το μη φορτισμένο tRNA θα πρέπει να υδρολύεται προκειμένου να αποτραπεί η εσφαλμένη σύνθεση πρωτεϊνών.
Εικόνα 01: Αμινοακυλο tRNA
Εκτός από τη λειτουργία στη σύνθεση πρωτεϊνών, το αμινοακυλο tRNA μπορεί επίσης να λειτουργήσει ως δότης αμινοξέων που είναι απαραίτητα για την τροποποίηση των λιπιδίων και τη βιοσύνθεση των αντιβιοτικών. Επιπλέον, είναι επίσης κατανοητό ότι οι συστάδες γονιδίων μπορούν να χρησιμοποιούν αμινοακυλο tRNA για τη ρύθμιση της σύνθεσης των κωδικοποιημένων πολυπεπτιδίων.
Τι είναι το Peptidyl tRNA;
Το Το πεπτιδυλικό tRNA είναι ένα μόριο tRNA που συνδέεται με τη θέση P του ριβοσώματος. Αφού σχηματιστεί σωστά το σύμπλοκο έναρξης, η μετάφραση προχωρά με επιμήκυνση του πολυπεπτιδίου. Το ριβόσωμα έχει τρεις θέσεις για σύνδεση tRNA: P (πεπτιδύλιο), Α (αμινοακύλιο) και Ε (υπάρχει).
Εικόνα 02: Πεπτιδυλικό tRNA
Το εναρκτήριο μεθειονυλ tRNA είναι πάντα συνδεδεμένο με τη θέση P. Το επόμενο αμινοακυλο tRNA δεσμεύεται στη θέση Α με τη βοήθεια ενός παράγοντα επιμήκυνσης (EF-Tu σε προκαρυώτες και eEf-1α στους ευκαρυώτες) και GTP. Μετά τη δέσμευση, απελευθερώνεται το μόριο GDP (υδρολυμένο GTP). Αργότερα, σχηματίζεται ένας πεπτιδικός δεσμός μεταξύ του tRNA του μεθειονυλίου στη θέση Ρ και του δεύτερου αμινοακυλικού tRNA στη θέση Α. Αυτή η αντίδραση καταλύεται από το ένζυμο πεπτιδυλ τρανσφεράση. Αυτή η αντίδραση μεταφέρει τη μεθειονίνη στο αμινοακυλο tRNA στη θέση Α, σχηματίζοντας έτσι ένα πεπτιδυλ tRNA. Επιπλέον, κατά το στάδιο της μετατόπισης, το πεπτιδυλικό tRNA μετακινείται στη θέση P του ριβοσώματος με τη βοήθεια παραγόντων επιμήκυνσης (EFG σε προκαρυώτες και eEf-2 στους ευκαρυώτες) και υδρόλυσης GTP. Επιπλέον, το μη φορτισμένο tRNA μετακινείται πρώτα στη θέση Ε του ριβοσώματος και στη συνέχεια φεύγει από τη θέση Ε στο τέλος της διαδικασίας.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ αμινοακυλο tRNA και πεπτιδυλο tRNA;
- Αμινοακυλο tRNA και πεπτιδυλο tRNA είναι δύο τύποι μορίων tRNA που συμμετέχουν στη μετάφραση.
- Και τα δύο είναι μόρια tRNA που αποτελούνται από βάσεις ριβονουκλεοτιδίων: αδενίνη, κυτοσίνη, γουανίνη και ουρακίλη.
- Τα αμινοξέα σχετίζονται και με τα δύο μόρια.
- Παίζουν ζωτικό ρόλο στη σύνθεση πρωτεϊνών.
- Και οι δύο συμμετέχουν στο βήμα επιμήκυνσης της μετάφρασης.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ tRNA αμινοακυλίου και tRNA πεπτιδυλίου;
Το Αμινοακυλο tRNA είναι ένα μόριο tRNA που συνδέεται με τη θέση Α του ριβοσώματος, ενώ το πεπτιδυλικό tRNA είναι ένα μόριο tRNA που είναι συνδεδεμένο στη θέση P του ριβοσώματος. Έτσι, αυτή είναι η βασική διαφορά μεταξύ του tRNA αμινοακυλίου και του πεπτιδυλικού tRNA. Επιπλέον, το αμινοακυλο tRNA φέρει ένα μόνο αμινοξύ στο άκρο ενώ το πεπτιδυλο tRNA φέρει μια πεπτιδική αλυσίδα στο άκρο.
Το παρακάτω infographic παραθέτει τις διαφορές μεταξύ αμινοακυλο tRNA και πεπτιδυλο tRNA σε μορφή πίνακα για σύγκριση δίπλα-δίπλα.
Σύνοψη – Αμινοακυλο tRNA έναντι πεπτιδυλο tRNA
Το tRNA είναι ένα μόριο που βοηθά στην αποκωδικοποίηση μιας αλληλουχίας mRNA σε μια πρωτεΐνη. Το αμινοακυλο tRNA και το πεπτιδυλο tRNA είναι δύο τύποι μορίων tRNA που συμμετέχουν στη διαδικασία μετάφρασης. Το αμινοακυλο tRNA συνδέεται με τη θέση Α του ριβοσώματος κατά τη διαδικασία μετάφρασης, ενώ το πεπτιδυλο tRNA συνδέεται με τη θέση Ρ του ριβοσώματος κατά τη διαδικασία μετάφρασης. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ αμινοακυλο tRNA και πεπτιδυλο tRNA.
