Η βασική διαφορά μεταξύ ssRNA και dsRNA είναι ότι το ssRNA έχει μόνο έναν κλώνο RNA ενώ το dsRNA αποτελείται από δύο συμπληρωματικούς κλώνους siRNA ή miRNA.
Το RNA ή ριβονουκλεϊκό οξύ είναι ένας τύπος νουκλεϊκού οξέος που αποτελείται από ριβονουκλεοτίδια. Γενικά, το RNA είναι ένα μονόκλωνο μόριο, σε αντίθεση με τη διπλή έλικα του DNA. Στην ταξινόμηση των ιών της Βαλτιμόρης, η ομάδα III, η ομάδα IV και η ομάδα V περιλαμβάνουν ιούς RNA. Ορισμένοι ιοί έχουν γονιδίωμα ssRNA ή μονόκλωνο RNA. Επομένως, το γονιδίωμά τους είναι κατασκευασμένο από έναν κλώνο RNA. Επιπλέον, ορισμένοι ιοί έχουν dsRNA ή γονιδίωμα δίκλωνου RNA. Ως εκ τούτου, το γονιδίωμά τους αποτελείται από δύο συμπληρωματικούς κλώνους RNA. Η τεχνική βαθμίδωσης πυκνότητας σακχαρόζης ή χλωριούχου καισίου μπορεί να διαχωρίσει τους ιούς ssRNA και τους ιούς dsRNA. Τα ελαφρύτερα σωματίδια είναι ιοί ssRNA, ενώ τα πυκνότερα σωματίδια περιέχουν dsRNA.
Τι είναι το ssRNA;
Το ssRNA σημαίνει μονόκλωνο RNA. Γενικά, το RNA είναι μονόκλωνο. Υπάρχουν ιοί που έχουν γονιδίωμα ssRNA. Είναι δύο τύποι: θετική αίσθηση και αρνητική αίσθηση με βάση την αίσθηση ή την πολικότητα του RNA. Το μονόκλωνο RNA θετικής αίσθησης συμπεριφέρεται ως mRNA. Ως εκ τούτου, μπορεί να μεταφραστεί απευθείας σε πρωτεΐνη. Το ssRNA με αρνητική έννοια είναι συμπληρωματικό του mRNA. Ως εκ τούτου, θα πρέπει να μετατραπεί σε θετικής λογικής ssRNA από RNA πολυμεράση εξαρτώμενη από το RNA. Μετά από αυτό, μπορεί να μεταφραστεί σε πρωτεΐνη.
Εικόνα 01: Ιοί RNA
Στην ταξινόμηση της Βαλτιμόρης, οι ιοί ssRNA με θετική έννοια ανήκουν στην Ομάδα IV, ενώ οι αρνητικοί ιοί ssRNA ανήκουν στην Ομάδα V. Σε διαβαθμίσεις πυκνότητας σακχαρόζης ή χλωριούχου καισίου, τα ελαφρύτερα σωματίδια περιέχουν ιούς ssRNA.
Τι είναι το dsRNA;
Το dsRNA σημαίνει δίκλωνο RNA. Στο dsRNA, υπάρχουν δύο συμπληρωματικοί κλώνοι RNA. Αυτοί οι κλώνοι ζευγαρώνονται μεταξύ τους σχηματίζοντας δεσμούς μεταξύ συμπληρωματικών βάσεων. Σε αντίθεση με το ssRNA, το dsRNA δεν είναι μακρύ – είναι ένα μικρό μόριο. Το dsRNA σχηματίζεται όταν συμπληρωματικοί κλώνοι DNA μεταγράφονται σε RNA με συμμετρική μεταγραφή από αντιτιθέμενους προαγωγείς. Επιπλέον, το ssRNA μπορεί να σχηματίσει ενδοκλωνικές διπλές έλικες που είναι dsRNA με συμπληρωματικό ζεύγος βάσεων. Το dsRNA μπορεί επίσης να σχηματιστεί με σύζευξη βάσεων συμπληρωματικών ssRNA που προκύπτουν από τρανσποζόνια και επαναλαμβανόμενα γονίδια.
Εικόνα 02: Ιός dsRNA
Ορισμένοι ιοί έχουν γονιδιώματα dsRNA. Αυτοί οι ιοί έχουν ευρύ φάσμα ξενιστών. Οι ροταϊοί και οι picobirnaviruses είναι ιοί dsRNA. Το γονιδίωμα dsRNA αυτών των ιών μεταγράφεται σε mRNA από RNA εξαρτώμενη από RNA πολυμεράση. Στη συνέχεια, τα μόρια mRNA μεταφράζονται σε ιικές πρωτεΐνες. Επιπλέον, ο κλώνος RNA με θετική έννοια μπορεί να χρησιμοποιηθεί και πάλι για την παραγωγή γονιδιωμάτων dsRNA για νέα ιικά σωματίδια. Στην ταξινόμηση της Βαλτιμόρης, το dsRNA ανήκει στην Ομάδα III. Οι ιοί dsRNA μολύνουν όλους τους οργανισμούς, συμπεριλαμβανομένων των θηλαστικών, των βακτηρίων, των φυτών και των μυκήτων.
Το μικρό παρεμβαλλόμενο RNA ή siRNA είναι ένας τύπος dsRNA που μπορεί να προκαλέσει παρεμβολή RNA στους ευκαρυώτες, καθώς και απόκριση ιντερφερόνης σε σπονδυλωτά.
Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ ssRNA και dsRNA;
- Υπάρχουν ιοί με ssRNA και dsRNA.
- Ένα μονόκλωνο μόριο RNA μπορεί να υποστεί συμπληρωματικό ζευγάρωμα βάσεων για να σχηματίσει ενδοκλωνικές διπλές έλικες που είναι dsRNA.
- Τόσο το ssRNA όσο και το dsRNA κατασκευάζονται από ριβονουκλεοτίδια που έχουν τέσσερις βάσεις. αδενίνη (Α), κυτοσίνη (C), γουανίνη (G) ή ουρακίλη (U), σάκχαρο ριβόζης και ομάδα φωσφορικών.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ ssRNA και dsRNA;
Η βασική διαφορά μεταξύ ssRNA και dsRNA είναι ότι το ssRNNA έχει μόνο έναν κλώνο, ενώ το dsRNA έχει δύο συμπληρωματικούς κλώνους RNA συζευγμένους μεταξύ τους. Στη φύση, το ssRNA βρίσκεται σε αφθονία ενώ το dsRNA είναι λιγότερο άφθονο. Στην ταξινόμηση της Βαλτιμόρης, οι ιοί ssRNA ανήκουν στην Ομάδα IV και V, ενώ οι ιοί dsRNA στην Ομάδα III.
Το παρακάτω infographic δείχνει τη διαφορά μεταξύ ssRNA και dsRNA σε μορφή πίνακα.
Σύνοψη – ssRNA έναντι dsRNA
Στη φύση, το RNA βρίσκεται ως ένα μονόκλωνο μόριο που διπλώνεται στον εαυτό του. Το mRNA είναι το μονόκλωνο μόριο RNA που μεταφράζεται σε πρωτεΐνη στα ριβοσώματα. Πολλοί ιοί έχουν γονιδιώματα RNA. Μερικοί ιοί έχουν γονιδιώματα ssRNA ενώ ορισμένοι ιοί διαθέτουν γονιδιώματα dsRNA. Το dsRNA έχει δύο συμπληρωματικούς κλώνους RNA που συνδέονται μεταξύ τους. Το ssRNA θετικής αίσθησης δρα απευθείας ως mRNA και μεταφράζεται σε ιικές πρωτεΐνες, ενώ το αρνητικό νόημα ssRNA μετατρέπεται σε θετικής αίσθησης ssRNA από την εξαρτώμενη από RNA πολυμεράση RNA και στη συνέχεια μεταφράζεται σε πρωτεΐνες. Το dsRNA μεταγράφεται σε mRNA από RNA εξαρτώμενη από RNA πολυμεράση και στη συνέχεια τα μόρια mRNA μεταφράζονται σε ιικές πρωτεΐνες. Έτσι, αυτό συνοψίζει τη διαφορά μεταξύ ssRNA και dsRNA.
